Protein–RNA interactions for Protein: Q6W4X9

MUC6, Mucin-6, humanhuman

Predictions only

Length 2,439 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MUC6Q6W4X9 ELAVL3-202ENST00000438662 1223 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 CNN2P6-201ENST00000439038 900 ntBASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 CMTM8-202ENST00000458535 996 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 FAM163B-202ENST00000496132 811 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC22.38■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC011511.4-201ENST00000586529 1850 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 NRM-201ENST00000259953 1755 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 TAZ-215ENST00000612460 1793 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 SHF-208ENST00000560734 1731 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 SYNGR1-201ENST00000216155 497 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 SDHC-201ENST00000342751 1127 ntTSL 1 (best) BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ESRRAP1-201ENST00000400596 1257 ntBASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 TESC-206ENST00000541210 936 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 CD151-213ENST00000528011 1369 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AP003071.3-201ENST00000562506 366 ntTSL 3 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 POLR2H-208ENST00000456318 1802 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.37■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ZNF580-201ENST00000325333 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 WIPF1-207ENST00000410117 777 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 EP300-AS1-201ENST00000420537 457 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ZNF436-AS1-202ENST00000437367 606 ntTSL 2 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ZNF580-203ENST00000545125 1025 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ATG101-201ENST00000336854 1439 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 MNX1-201ENST00000252971 2174 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 OSR2-210ENST00000523368 1519 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 MAP1LC3A-202ENST00000374837 961 ntTSL 3 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ZNF292-204ENST00000392985 1096 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 EIF4E3-203ENST00000421769 777 ntTSL 1 (best) BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AL845552.2-201ENST00000553301 553 ntTSL 4 BASIC22.36■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 SH3GLB2-202ENST00000372559 1365 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 FNDC11-201ENST00000370097 1119 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 KAT8-202ENST00000448516 1789 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC141586.4-201ENST00000624558 1573 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 PPP1R3F-205ENST00000495799 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 BCAT2-208ENST00000598162 1329 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 TST-202ENST00000403892 1797 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 COX5B-201ENST00000258424 712 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 KRTAP17-1-201ENST00000334202 779 ntAPPRIS P1 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 C2CD4B-201ENST00000380392 1579 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 C19orf81-201ENST00000425202 765 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ADM-205ENST00000528544 586 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 FBXL12-203ENST00000586073 582 ntTSL 2 BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 LINC01023-201ENST00000606054 436 ntBASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 REST-211ENST00000640168 1268 ntTSL 1 (best) BASIC22.35■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 TRIM14-203ENST00000375098 1792 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AGAP3-211ENST00000473312 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 RAPSN-205ENST00000529341 1408 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 ZNF653-201ENST00000293771 2240 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 RARRES2P4-201ENST00000514074 484 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC133552.2-202ENST00000575694 574 ntBASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 VIL1-204ENST00000440053 1454 ntTSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 DCBLD1-201ENST00000296955 1979 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.34■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 CKLF-201ENST00000264001 669 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 GTF2A2-203ENST00000396061 758 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC114730.1-201ENST00000400768 472 ntTSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC010531.1-201ENST00000568879 953 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 PWWP2B-201ENST00000305233 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 AC044860.1-203ENST00000560811 844 ntTSL 3 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 MCRIP1-206ENST00000573478 1123 ntTSL 2 BASIC22.33■■□□□ 1.17
MUC6Q6W4X9 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.33■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 LINC01637-201ENST00000444039 684 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AL445228.2-201ENST00000605589 952 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RASL12-202ENST00000421977 1523 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC005789.1-201ENST00000585411 297 ntTSL 3 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC006058.3-201ENST00000606217 1069 ntBASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 CD24-208ENST00000622315 825 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 CNN3-202ENST00000394202 1974 ntTSL 2 BASIC22.32■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 LIMD2-206ENST00000578993 602 ntTSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC005697.1-201ENST00000582441 582 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RAB24-202ENST00000303270 1385 ntTSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RHOC-203ENST00000369632 1026 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PPP1R14BP2-201ENST00000426284 444 ntBASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 CEND1-201ENST00000330106 1649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 PXK-201ENST00000302779 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 MBD3L1-202ENST00000595891 872 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 MMD2-204ENST00000612910 778 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC007405.3-201ENST00000429172 561 ntTSL 3 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 MIR4758-201ENST00000577688 71 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 AC083880.1-201ENST00000608266 535 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
MUC6Q6W4X9 BX005040.4-201ENST00000637145 1518 ntBASIC22.3■■□□□ 1.16
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.6 ms