Protein–RNA interactions for Protein: Q6NZI2

CAVIN1, Caveolae-associated protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 390 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CAVIN1Q6NZI2 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC25.54■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AC133552.2-201ENST00000619106 1032 ntBASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PLEKHA8-203ENST00000396259 2840 ntTSL 2 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC25.53■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 WBP1-201ENST00000233615 1294 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 NKX6-1-202ENST00000515820 2194 ntTSL 3 BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.52■■□□□ 1.68
CAVIN1Q6NZI2 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 STK32C-205ENST00000456004 607 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC25.51■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 SOCS2-202ENST00000536696 1065 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 GRK3-203ENST00000619906 2873 ntTSL 5 BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 DLEU2-208ENST00000621282 3068 ntTSL 1 (best) BASIC25.5■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 SPIRE2-202ENST00000393062 2172 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 AC080112.2-201ENST00000578774 2094 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MPST-203ENST00000401419 1345 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 TMEM191C-206ENST00000432134 1129 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MANF-204ENST00000528157 1153 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC25.49■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC25.48■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 FAH-202ENST00000407106 2152 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 U2AF1-201ENST00000291552 962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 LPCAT4-201ENST00000314891 2262 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.47■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 PSMG3-202ENST00000288607 1391 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 MADCAM1-202ENST00000346144 1309 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 CFAP77-202ENST00000393215 901 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC25.46■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC25.45■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.67
CAVIN1Q6NZI2 ENDOG-201ENST00000372642 1172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AGO3-204ENST00000397828 1035 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 AC018755.3-202ENST00000596210 929 ntBASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 PDXK-205ENST00000398081 2251 ntTSL 2 BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.45■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 CIZ1-203ENST00000357558 2907 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 ITGBL1-206ENST00000618057 2368 ntTSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 RPS2-202ENST00000526522 924 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SAP30L-201ENST00000297109 6226 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 C19orf12-201ENST00000323670 2464 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC25.44■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 ONECUT3-201ENST00000382349 8318 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
CAVIN1Q6NZI2 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC25.43■■□□□ 1.66
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 75.3 ms