Protein–RNA interactions for Protein: Q6NWY9

PRPF40B, Pre-mRNA-processing factor 40 homolog B, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 871 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PRPF40BQ6NWY9 ABHD8-201ENST00000247706 2090 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.98■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 MAGI2-215ENST00000628980 6212 ntTSL 5 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.97■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 AL353743.1-201ENST00000637846 1769 ntTSL 5 BASIC27.96■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.07
PRPF40BQ6NWY9 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 EPM2A-209ENST00000638262 2679 ntTSL 1 (best) BASIC27.95■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 CPLX1-203ENST00000505203 2011 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 GALNT12-201ENST00000375011 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC27.94■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 ALDH16A1-203ENST00000540132 2174 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 CBLN2-209ENST00000585159 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC27.93■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 GOLGA7-201ENST00000357743 2027 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AL161729.1-201ENST00000604104 1402 ntBASIC27.92■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A2-201ENST00000247138 1672 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AL590128.2-201ENST00000442889 415 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC27.91■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC27.9■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 EML2-209ENST00000587152 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.06
PRPF40BQ6NWY9 ST3GAL5-269ENST00000640992 2292 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.89■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 GNPTG-201ENST00000204679 1983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC27.88■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 CCM2L-201ENST00000262659 2523 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 ARMC10-208ENST00000441711 2524 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.87■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.86■■■□□ 2.05
PRPF40BQ6NWY9 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.86■■■□□ 2.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.7 ms