Protein–RNA interactions for Protein: Q5VWG9

TAF3, Transcription initiation factor TFIID subunit 3, humanhuman

Predictions only

Length 929 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TAF3Q5VWG9 PLEKHA8-208ENST00000622102 2140 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 DUSP9-201ENST00000342782 2433 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 GALNT8-202ENST00000433855 5977 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 RAB11FIP4-211ENST00000621161 8628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 SLC22A17-201ENST00000206544 2284 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 PCDH1-204ENST00000503492 2373 ntTSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TAF3Q5VWG9 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 C8orf82-202ENST00000524821 2476 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 ANOS2P-203ENST00000472227 1816 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 LINC01925-201ENST00000579492 500 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 AC137630.3-201ENST00000607245 391 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DXO-201ENST00000337523 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 SENP5-202ENST00000419026 973 ntTSL 3 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 STARD10-201ENST00000334805 1963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DNAJA4-202ENST00000394852 3116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 TK2-202ENST00000417693 1046 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 MIR663AHG-227ENST00000608084 765 ntTSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 SRPK3-204ENST00000370108 1863 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 ZGPAT-201ENST00000328969 1945 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 LARGE2-208ENST00000531526 2528 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 MCRIP1-202ENST00000457257 942 ntTSL 3 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 AC092849.1-201ENST00000475250 303 ntTSL 4 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 SNX5-217ENST00000606557 1087 ntBASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 PATZ1-201ENST00000215919 2516 ntTSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 PCK2-201ENST00000216780 2357 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC24.22■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 NSMF-201ENST00000265663 2981 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 NSMF-206ENST00000371475 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CTAG1B-201ENST00000328435 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 MTMR14-202ENST00000351233 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 KLHL26-202ENST00000595182 522 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CTAG1A-202ENST00000599837 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 AC119427.1-201ENST00000633182 556 ntTSL 4 BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.21■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 DNAAF3-203ENST00000524407 2059 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.47
TAF3Q5VWG9 ZDHHC17-201ENST00000426126 5259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC24.2■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ZNF180-205ENST00000587047 525 ntTSL 4 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 NEU4-202ENST00000391969 2526 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 IGF2-AS-201ENST00000381361 2063 ntTSL 2 BASIC24.19■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 JAKMIP1-201ENST00000282924 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 AC090360.1-201ENST00000569722 2218 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
TAF3Q5VWG9 ZNF213-208ENST00000576416 2240 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.18■■□□□ 1.46
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 34.6 ms