Protein–RNA interactions for Protein: Q5T0T0

MARCH8, E3 ubiquitin-protein ligase MARCH8, humanhuman

Predictions only

Length 291 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MARCH8Q5T0T0 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AL358852.1-201ENST00000623174 1268 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.62■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 OTUD5-203ENST00000396743 2682 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 FAM219A-202ENST00000379078 770 ntTSL 3 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 FAM219A-205ENST00000379084 893 ntTSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AC027612.3-201ENST00000413684 1047 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 BCAP29-209ENST00000465919 942 ntTSL 2 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.61■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 TMEM266-201ENST00000388942 2520 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 BHLHA9-201ENST00000391429 902 ntAPPRIS P1 BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 BTBD17-201ENST00000375366 1805 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 CYP2A13-201ENST00000330436 1739 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.6■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 STX18-205ENST00000505286 1380 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 ASPDH-202ENST00000389208 1040 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 SLC25A29-201ENST00000359232 2385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.59■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 TAZ-205ENST00000475699 1862 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 PYY-201ENST00000360085 1053 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 MRPL14-201ENST00000372014 959 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 AC034268.1-201ENST00000441047 882 ntBASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 LINC01942-201ENST00000521373 513 ntTSL 4 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 RAB43-208ENST00000615093 783 ntTSL 5 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.58■■□□□ 1.53
MARCH8Q5T0T0 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.58■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 H1FX-AS1-204ENST00000511998 917 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L2-201ENST00000561772 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4-206ENST00000616166 1275 ntAPPRIS P2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L6-201ENST00000626483 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L1-201ENST00000627662 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L8-201ENST00000629013 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L3-201ENST00000630187 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L7-201ENST00000630678 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DUX4L5-201ENST00000630834 1275 ntBASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AL133516.1-201ENST00000633012 540 ntTSL 5 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC24.57■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 IQCJ-SCHIP1-202ENST00000460298 1884 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 GLI3-203ENST00000437480 451 ntTSL 2 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AC123595.1-201ENST00000440769 1046 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 DHH-201ENST00000266991 1936 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 OAZ2-201ENST00000326005 1934 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.56■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 GUK1-207ENST00000366726 873 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 MFSD14C-201ENST00000375223 619 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AC096541.1-201ENST00000445070 1807 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 ARG2-201ENST00000261783 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 PEX11G-203ENST00000593942 1345 ntTSL 5 BASIC24.55■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 C7orf26-202ENST00000359073 1762 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 CRB3-202ENST00000356762 733 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 MPC1-202ENST00000360961 962 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 AC093817.1-201ENST00000507296 812 ntTSL 3 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 FLOT1-201ENST00000376389 1912 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 POU2F3-206ENST00000543440 1953 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 TMED4-205ENST00000481238 1755 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 LY6E-201ENST00000292494 1181 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 PRR25-201ENST00000301698 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 KRT18P5-201ENST00000436075 1291 ntBASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 TMEM70-203ENST00000517439 617 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 CDCP1-202ENST00000425231 1416 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 TSPAN2-201ENST00000369515 793 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
MARCH8Q5T0T0 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 39 ms