Protein–RNA interactions for Protein: Q5SYB0

FRMPD1, FERM and PDZ domain-containing protein 1, humanhuman

Predictions only

Length 1,578 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FRMPD1Q5SYB0 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.03
FRMPD1Q5SYB0 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.95■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 COL13A1-203ENST00000398969 2267 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC33.95■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 HAGH-201ENST00000397353 1257 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 LSR-205ENST00000427250 1606 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CERKL-204ENST00000374970 1392 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 FNDC3B-204ENST00000421757 946 ntTSL 1 (best) BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AC108693.2-201ENST00000492981 303 ntTSL 3 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AC007216.1-201ENST00000570197 601 ntTSL 4 BASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AC011767.1-201ENST00000617410 1153 ntBASIC33.94■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 GATA4-209ENST00000622443 1982 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 OSCAR-205ENST00000359649 1892 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 HERC2P5-204ENST00000569697 1214 ntTSL 2 BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 MFSD14C-203ENST00000602917 786 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 FUT11-202ENST00000394790 2175 ntTSL 1 (best) BASIC33.93■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 KRT72-202ENST00000354310 1764 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CCDC74B-205ENST00000409943 1296 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AP002748.1-201ENST00000504911 580 ntTSL 3 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CAMTA1-216ENST00000557126 486 ntTSL 2 BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 FCRLB-205ENST00000367948 1977 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.92■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CBR1-201ENST00000290349 1293 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 DET1-205ENST00000558413 583 ntTSL 4 BASIC33.91■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AC098934.4-201ENST00000564127 592 ntBASIC33.91■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC33.91■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 TANGO2-207ENST00000420290 1859 ntTSL 2 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AGAP1-IT1-201ENST00000440498 664 ntTSL 3 BASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 LTB-211ENST00000446745 853 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 TSPY6P-201ENST00000448518 926 ntBASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 CDH24-206ENST00000610348 2037 ntTSL 1 (best) BASIC33.9■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 AC069152.1-201ENST00000438030 544 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 ATPIF1-204ENST00000497986 599 ntTSL 2 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 ZNF561-AS1-205ENST00000588765 579 ntTSL 4 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 HSD17B14-204ENST00000599157 991 ntTSL 3 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 PORCN-203ENST00000359882 1877 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 C19orf73-201ENST00000408991 744 ntAPPRIS P1 BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.02
FRMPD1Q5SYB0 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC33.89■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 TBXA2R-202ENST00000411851 1494 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 BAMBI-201ENST00000375533 1877 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 LINC01342-201ENST00000416774 1620 ntTSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 METTL15-202ENST00000403099 795 ntTSL 5 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AP000282.1-201ENST00000454622 682 ntTSL 2 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC33.88■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 PDPK1-204ENST00000441549 1729 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AL138781.1-201ENST00000566567 1274 ntBASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 PARP1-210ENST00000629232 477 ntTSL 5 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 FZD2-201ENST00000315323 2112 ntAPPRIS P1 BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 ZNF775-201ENST00000329630 2257 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC33.87■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 TMEM218-201ENST00000279968 1034 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AC093762.3-201ENST00000641918 318 ntAPPRIS P1 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 TOR2A-201ENST00000336067 1370 ntTSL 2 BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SEC22C-207ENST00000423701 1458 ntTSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 DNAJC21-201ENST00000342382 2309 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.86■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 MOB2-201ENST00000329957 1207 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 ORMDL1-202ENST00000392349 1137 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 VRK2-202ENST00000412104 1916 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AP006621.1-202ENST00000528982 464 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 POLR2J-202ENST00000393794 784 ntTSL 1 (best) BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 MAZ-216ENST00000616501 991 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 TFG-210ENST00000620299 1289 ntTSL 5 BASIC33.85■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 CCDC106-202ENST00000586790 2162 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 ILKAP-211ENST00000612675 1335 ntTSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 GYG2-205ENST00000398806 1956 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 HAGH-203ENST00000455446 1276 ntTSL 2 BASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC33.84■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 BTBD6-203ENST00000392554 2176 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC33.83■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC33.83■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-206ENST00000502374 1034 ntTSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 PACRGL-208ENST00000503585 1582 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC33.83■■■■□ 3.01
FRMPD1Q5SYB0 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC33.82■■■■□ 3
FRMPD1Q5SYB0 RHOD-201ENST00000308831 1129 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC33.82■■■■□ 3
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 18.6 ms