Protein–RNA interactions for Protein: Q5SQQ9

VAX1, Ventral anterior homeobox 1, humanhuman

Predictions only

Length 334 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VAX1Q5SQQ9 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.71■□□□□ 0.59
VAX1Q5SQQ9 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LMAN2-208ENST00000515209 1149 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 HEXB-201ENST00000261416 1901 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 C19orf12-204ENST00000392276 1912 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LRRC45-201ENST00000306688 2701 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 DTNB-207ENST00000405222 2273 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC18.7■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 SHISA8-202ENST00000621082 1405 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 SPCS2P3-201ENST00000500401 656 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 YAP1-210ENST00000615667 5398 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 C19orf12-207ENST00000592153 1504 ntTSL 1 (best) BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC18.69■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LONRF2P2-201ENST00000439212 571 ntBASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.68■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 PARD3-213ENST00000545260 5740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 RBM33-201ENST00000287912 1404 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ZNF688-203ENST00000563276 1492 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MIR6765-201ENST00000614092 87 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC18.67■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 CARNMT1-201ENST00000376830 1012 ntTSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LY6K-201ENST00000292430 2671 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 FBXO25-203ENST00000352684 2360 ntTSL 5 BASIC18.66■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 AL592293.1-201ENST00000502889 1188 ntBASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LINC01233-202ENST00000598832 568 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 FP236240.1-201ENST00000619537 1116 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 MRPL4-207ENST00000590669 1423 ntTSL 1 (best) BASIC18.65■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.58
VAX1Q5SQQ9 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 OSBPL10-204ENST00000438237 2624 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 C20orf24-201ENST00000342422 896 ntTSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 C20orf24-202ENST00000344795 1114 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC011448.1-201ENST00000555938 1100 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 AC090241.2-201ENST00000602329 432 ntTSL 4 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC18.64■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 LBH-205ENST00000407930 756 ntTSL 2 BASIC18.63■□□□□ 0.57
VAX1Q5SQQ9 LYPD6B-204ENST00000409876 1248 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.63■□□□□ 0.57
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms