Protein–RNA interactions for Protein: Q5C9Z4

NOM1, Nucleolar MIF4G domain-containing protein 1, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 860 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
NOM1Q5C9Z4 SLC9A3-201ENST00000264938 2584 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 EMC9-206ENST00000560403 872 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 CCDC92B-201ENST00000575506 885 ntBASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 TRIM72-202ENST00000613872 1573 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 AC131274.2-201ENST00000580697 1507 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC26.45■■□□□ 1.83
NOM1Q5C9Z4 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 ARMC10-204ENST00000425331 2443 ntTSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 SH2D3A-202ENST00000437152 2013 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 PITX1-205ENST00000506438 1305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 NOCT-201ENST00000280614 1952 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 RCC2-201ENST00000375433 2030 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 MYH7B-209ENST00000618182 6197 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.43■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 PPP2R2D-201ENST00000455566 5738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 BSPRY-201ENST00000374183 2339 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 MADCAM1-208ENST00000621286 1203 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 FOXP4-203ENST00000373060 5948 ntTSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 FOXP4-204ENST00000373063 5910 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 MEIS3-201ENST00000331559 2104 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 ZFYVE28-202ENST00000503000 1874 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 PTPRM-201ENST00000332175 6095 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 PCOLCE2-201ENST00000295992 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 MIR572-201ENST00000384983 95 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 C5orf58-204ENST00000521850 2113 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 TMEM256-PLSCR3-204ENST00000573331 2557 ntAPPRIS P5 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 HIST1H2AM-201ENST00000359611 393 ntAPPRIS P1 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 NDUFV2-AS1-201ENST00000582375 770 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 PCP4L1-201ENST00000504449 1424 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 HNRNPAB-201ENST00000355836 1602 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 RUNX2-210ENST00000576263 2256 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
NOM1Q5C9Z4 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC26.39■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 PHLPP1-201ENST00000262719 6390 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 SLC22A31-206ENST00000614943 1860 ntTSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 ATP5G2-201ENST00000338662 1792 ntTSL 2 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 CACNA1H-210ENST00000638323 8048 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 ZDHHC1-201ENST00000348579 2047 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 USF2-201ENST00000222305 1634 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 ZNHIT2-201ENST00000310597 1306 ntAPPRIS P1 BASIC26.38■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 ABHD16B-201ENST00000369916 1491 ntAPPRIS P1 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 NR2F6-201ENST00000291442 2404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 LINC01578-209ENST00000557682 2683 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 C11orf24-209ENST00000533310 980 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 ADSSL1-201ENST00000330877 1766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC26.37■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.36■■□□□ 1.81
NOM1Q5C9Z4 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC26.36■■□□□ 1.81
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 47.3 ms