Protein–RNA interactions for Protein: Q53GD3

SLC44A4, Choline transporter-like protein 4, humanhuman

Predictions only

Length 710 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SLC44A4Q53GD3 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SNUPN-201ENST00000308588 1513 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.07■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 NAGS-201ENST00000293404 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ZC3H14-202ENST00000302216 2560 ntTSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 MTMR14-206ENST00000420925 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ARRB2-210ENST00000572457 1660 ntTSL 5 BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.06■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 TRIM2-212ENST00000632856 656 ntTSL 3 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ALDH1A3-203ENST00000557963 1670 ntBASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 NIPA2-205ENST00000539711 1412 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 DYRK2-203ENST00000393555 2209 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 EXOG-203ENST00000422077 1317 ntTSL 2 BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.05■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 CADM4-201ENST00000222374 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 AC022211.4-201ENST00000625094 2161 ntBASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.04■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 MED17-227ENST00000640521 2047 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 ATP13A2-215ENST00000617114 1723 ntTSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 WIPI2-202ENST00000382384 1948 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SLC10A4-201ENST00000273861 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 DCAF15-201ENST00000254337 2278 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 CBWD2-201ENST00000259199 1812 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 MYO10-205ENST00000507288 1677 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 DCUN1D2-208ENST00000478244 2045 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 BIN1-205ENST00000351659 2365 ntTSL 1 (best) BASIC23.03■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 MEIOB-203ENST00000412554 1884 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 AC138932.3-201ENST00000567634 1902 ntBASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SNX21-204ENST00000372542 1824 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 RFC2-201ENST00000055077 1695 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 SCTR-201ENST00000019103 1865 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 FBXW5-201ENST00000325285 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.02■■□□□ 1.28
SLC44A4Q53GD3 HLA-L-211ENST00000482052 1765 ntBASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ARMC6-201ENST00000269932 2412 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 MFSD5-201ENST00000329548 1760 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 RING1-201ENST00000374656 1752 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.01■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SOX10-202ENST00000396884 2879 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 RAP1B-207ENST00000450214 1466 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 C2orf82-201ENST00000331342 465 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 LHPP-203ENST00000392757 840 ntTSL 3 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
SLC44A4Q53GD3 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 49.8 ms