Protein–RNA interactions for Protein: Q15858

SCN9A, Sodium channel protein type 9 subunit alpha, humanhuman

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Length 1,988 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SCN9AQ15858 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 ADAD2-202ENST00000315906 1995 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC27.05■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 POLE4-205ENST00000483063 1248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 AP003733.4-201ENST00000623785 1697 ntBASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 UCHL5-201ENST00000367448 1534 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 MAP2K2-201ENST00000262948 1734 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 P2RY2-202ENST00000393596 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.04■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 INPP5J-206ENST00000404453 1613 ntTSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.03■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 BIN1-201ENST00000259238 2338 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 SUGCT-201ENST00000335693 1645 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 BCKDHB-203ENST00000369760 743 ntTSL 3 BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.02■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.92
SCN9AQ15858 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 KRT72-201ENST00000293745 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.01■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 KIAA2013-201ENST00000376572 2815 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC27■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 C11orf80-204ENST00000525908 2135 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 UBE2J2-203ENST00000360466 1047 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC26.99■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC016769.1-201ENST00000409132 1010 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.98■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 YIF1A-205ENST00000471387 854 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 SPRED3-202ENST00000586301 1366 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 OTUD5-208ENST00000610466 2487 ntTSL 5 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 SMIM12-202ENST00000423898 897 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC26.97■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 TRIM54-201ENST00000296098 2027 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC073111.5-205ENST00000641717 521 ntBASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 FAM167A-204ENST00000528897 1620 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.96■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.95■■□□□ 1.91
SCN9AQ15858 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC26.95■■□□□ 1.91
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