Protein–RNA interactions for Protein: Q15477

SKIV2L, Helicase SKI2W, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 1,246 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKIV2LQ15477 CFAP99-207ENST00000635017 2298 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AKAP17A-202ENST00000381261 2187 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 TWF2-201ENST00000305533 1718 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 UTF1-201ENST00000304477 1157 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 FAM160B1-201ENST00000369246 666 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ANKRD63-201ENST00000434396 1143 ntAPPRIS P1 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 RAB6A-204ENST00000536566 1267 ntTSL 5 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ATG16L2-205ENST00000534905 1614 ntTSL 1 (best) BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 CSNK1G3-207ENST00000512718 1569 ntTSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AP004607.4-201ENST00000530158 1459 ntBASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 MROH6-211ENST00000534459 1789 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.68■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 GPS1-204ENST00000392358 2276 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 HNF4A-205ENST00000443598 1603 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 IDH2-203ENST00000559482 1278 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 SLC35A3-218ENST00000639994 1114 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 P2RX4-203ENST00000359949 1836 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 E2F5-202ENST00000416274 1728 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 FGF19-201ENST00000294312 2447 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.67■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ANKRD10-202ENST00000310847 1193 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 KRT19P1-201ENST00000405746 1186 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 DUX4L4-201ENST00000566884 1269 ntBASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 GALNS-211ENST00000568311 703 ntTSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 C10orf95-201ENST00000625129 1469 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 TANGO2-204ENST00000401833 1920 ntTSL 5 BASIC23.66■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 GPR150-201ENST00000380007 2065 ntAPPRIS P1 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 CITED1-201ENST00000246139 1231 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 TP53I11-215ENST00000531928 1078 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ARL16-209ENST00000573715 763 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 ARL16-211ENST00000576135 694 ntTSL 3 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 MDK-213ENST00000617138 635 ntTSL 2 BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 SPG21-201ENST00000204566 1822 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 BCAP31-207ENST00000458587 1810 ntTSL 1 (best) BASIC23.65■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 MTMR1-202ENST00000370390 2755 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.38
SKIV2LQ15477 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AC093627.4-202ENST00000479592 591 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 PTRH1-205ENST00000423807 1570 ntTSL 2 BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 PLPPR3-201ENST00000359894 2387 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.64■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 KANSL2-215ENST00000553086 1830 ntTSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SNTA1-201ENST00000217381 2342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ACOT8-201ENST00000217455 1168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 IDH1-AS1-202ENST00000448588 489 ntTSL 3 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 BTBD6-204ENST00000463376 2195 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ARHGAP24-206ENST00000503995 1273 ntTSL 1 (best) BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SPI1-203ENST00000533030 661 ntTSL 2 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AC142086.2-201ENST00000569753 217 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 MIR4651-201ENST00000582622 73 ntBASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 C11orf80-210ENST00000527634 1666 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.63■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 DACT2-202ENST00000366796 2028 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 RFLNA-205ENST00000546355 2354 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AC074212.1-201ENST00000559756 1402 ntTSL 3 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 JSRP1-201ENST00000300961 1138 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 KLK9-202ENST00000594211 754 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 GAMT-205ENST00000640762 751 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ANKS3-204ENST00000585773 1946 ntTSL 2 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ZDHHC16-207ENST00000393760 2014 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.62■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 RHBDL3-204ENST00000538145 1338 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 NPAS3-203ENST00000357798 2763 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 KRT18P11-201ENST00000435214 1283 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SERTAD4-AS1-201ENST00000437764 726 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 CDKN3-204ENST00000442975 727 ntTSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 LITAF-205ENST00000570904 1118 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 AL121832.2-201ENST00000610979 668 ntBASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 FANCE-201ENST00000229769 2554 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 EVA1C-201ENST00000300255 1998 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.61■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 KLC1-225ENST00000557575 2188 ntTSL 5 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 CHEK2P2-202ENST00000555186 864 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 KLF13-207ENST00000560473 489 ntTSL 3 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 LINC01976-201ENST00000565120 434 ntTSL 2 BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 OSCAR-207ENST00000391761 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 FLT1-202ENST00000539099 1911 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 C3orf18-205ENST00000441239 1490 ntTSL 1 (best) BASIC23.6■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 MSANTD2-201ENST00000239614 2495 ntTSL 2 BASIC23.59■■□□□ 1.37
SKIV2LQ15477 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.59■■□□□ 1.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 119.5 ms