Protein–RNA interactions for Protein: Q15116

PDCD1, Programmed cell death protein 1, humanhuman

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Length 288 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PDCD1Q15116 MIR6724-2-201ENST00000616483 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MIR6724-4-201ENST00000617390 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MIR6724-3-201ENST00000622482 92 ntBASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 EXOG-217ENST00000630638 197 ntTSL 5 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 HAUS3-202ENST00000443786 2430 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 ITM2C-202ENST00000326427 2078 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 FRAT1-201ENST00000371021 2649 ntAPPRIS P1 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 H2AFY-217ENST00000511689 2789 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.97■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 REST-206ENST00000612429 1376 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 REST-207ENST00000616975 1370 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AC008406.3-201ENST00000620001 1374 ntBASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 REST-212ENST00000640343 1352 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 SUSD3-202ENST00000375472 1195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC18.96■□□□□ 0.63
PDCD1Q15116 HNRNPD-202ENST00000352301 1667 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CACNA1H-202ENST00000358590 8069 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 FIZ1-201ENST00000221665 2660 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 REXO1-201ENST00000170168 4591 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 IGFBP7-203ENST00000514062 1251 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ELL3-201ENST00000319359 2352 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.95■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CACYBP-201ENST00000367679 2766 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SUMF1-205ENST00000458465 1102 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SLC25A29-202ENST00000392908 2242 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SIGMAR1-201ENST00000277010 1656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PYCR1-203ENST00000402252 1346 ntTSL 2 BASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 JMJD1C-AS1-201ENST00000609436 1335 ntBASIC18.94■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 HNRNPAB-208ENST00000515193 1595 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.93■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PCMTD2-202ENST00000299468 1049 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 DNAJC4-202ENST00000321685 1288 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 MIR6722-201ENST00000617286 78 ntBASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TMEM240-203ENST00000624426 796 ntTSL 3 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 DNAJC4-212ENST00000628077 938 ntTSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ZBTB22-208ENST00000431845 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.92■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 DGKQ-201ENST00000273814 4636 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 RAB33A-201ENST00000257017 1258 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TRIM7-202ENST00000334421 1228 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PLEKHJ1-213ENST00000591099 1092 ntTSL 2 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC18.91■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 STEAP2-204ENST00000394626 2456 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AC004540.2-202ENST00000451264 508 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ERRFI1-203ENST00000469499 995 ntTSL 3 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC18.9■□□□□ 0.62
PDCD1Q15116 NTN1-201ENST00000173229 5954 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.9■□□□□ 0.62
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