Protein–RNA interactions for Protein: Q15012

LAPTM4A, Lysosomal-associated transmembrane protein 4A, humanhuman

Predictions only

Length 233 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
LAPTM4AQ15012 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC010980.1-201ENST00000587192 1142 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 KCNT1-201ENST00000263604 5245 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MEIS2-207ENST00000557796 2666 ntTSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 PNRC1-201ENST00000336032 2065 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC20.65■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 FMR1-201ENST00000218200 4333 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.9
LAPTM4AQ15012 R3HCC1-202ENST00000411463 1467 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 STX5-201ENST00000294179 1794 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.64■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 OSBPL5-208ENST00000478260 2653 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ANKRD13D-202ENST00000447274 2881 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 DNAJC25-201ENST00000313525 2268 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 NR0B1-202ENST00000378970 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 MAGI2-212ENST00000626691 4599 ntTSL 5 BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ZDHHC5-204ENST00000527985 2817 ntTSL 1 (best) BASIC20.63■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 RSPO1-201ENST00000356545 2621 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 WHAMM-201ENST00000286760 5101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CITED4-201ENST00000372638 1316 ntAPPRIS P1 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 GUK1-208ENST00000366728 842 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 BEX3-202ENST00000372634 753 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 HAGHL-205ENST00000561546 1041 ntTSL 2 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC120024.1-201ENST00000562672 995 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.62■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 WRAP73-201ENST00000270708 1665 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 MAGI2-202ENST00000419488 6800 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 FAM66C-208ENST00000541558 2087 ntTSL 2 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PDIA2-201ENST00000219406 1698 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.61■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SAMD13-205ENST00000370673 1567 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 BAZ1A-201ENST00000358716 5920 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 CCDC37-AS1-202ENST00000506660 986 ntTSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AL033527.3-201ENST00000566366 1196 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ATXN3-252ENST00000620536 1044 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ATXN3-253ENST00000621269 936 ntTSL 5 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SPOCK3-222ENST00000512681 1457 ntTSL 2 BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PKD1P6-201ENST00000343738 4769 ntBASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.6■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 SAV1-201ENST00000324679 3063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 D2HGDH-201ENST00000321264 2617 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 TMEM165-201ENST00000381334 1928 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 AC012354.3-201ENST00000623734 483 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.59■□□□□ 0.89
LAPTM4AQ15012 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC20.59■□□□□ 0.89
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 41.1 ms