Protein–RNA interactions for Protein: Q13829

TNFAIP1, BTB/POZ domain-containing adapter for CUL3-mediated RhoA degradation protein 2, humanhuman

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Length 316 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNFAIP1Q13829 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 UHRF2-202ENST00000381373 802 ntTSL 3 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 RAMP2-201ENST00000253796 780 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.48■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 GSR-204ENST00000537535 1323 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.47■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC26.46■■□□□ 1.83
TNFAIP1Q13829 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.45■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC26.44■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC26.43■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC26.42■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.41■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC26.4■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC26.39■■□□□ 1.82
TNFAIP1Q13829 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.39■■□□□ 1.81
TNFAIP1Q13829 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC26.39■■□□□ 1.81
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