Protein–RNA interactions for Protein: Q13496

MTM1, Myotubularin, humanhuman

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Length 603 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTM1Q13496 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 NELFCD-213ENST00000602795 2305 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 CLTA-206ENST00000466396 695 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 SNHG12-212ENST00000531126 719 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 AC243829.1-202ENST00000618848 486 ntTSL 3 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 DENND5A-201ENST00000328194 5031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 SEPT8-207ENST00000378719 2889 ntTSL 1 (best) BASIC22.91■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 KCNQ4-204ENST00000509682 1926 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 C4orf36-201ENST00000295898 881 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 TRIR-202ENST00000588213 841 ntTSL 3 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 U2AF2-202ENST00000450554 3022 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 ZNF707-222ENST00000532158 2218 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 AC093323.1-201ENST00000307533 2311 ntTSL 1 (best) BASIC22.9■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 MFSD7-202ENST00000347950 1599 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 ARHGEF9-204ENST00000374878 2217 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.26
MTM1Q13496 SLC12A2-201ENST00000262461 6885 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 NPTXR-201ENST00000333039 5784 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ERGIC1-206ENST00000519860 1000 ntTSL 3 BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 CADPS-203ENST00000383710 5471 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 HAS1-202ENST00000540069 2110 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 AL117336.3-202ENST00000605499 489 ntTSL 3 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.88■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 HADH-209ENST00000603302 2032 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 PAXBP1-201ENST00000290178 2564 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 C1QTNF12-201ENST00000330388 1036 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 HDHD5-203ENST00000399852 1118 ntTSL 3 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 SNHG7-201ENST00000414282 2357 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 HOXA10-201ENST00000283921 2541 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 PPP2R3B-202ENST00000390665 2151 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 DMPK-220ENST00000618091 2503 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 PNMA6A-201ENST00000421798 2209 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 MSANTD3-207ENST00000622639 1748 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 TMEM179-204ENST00000556573 1430 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 C16orf95-201ENST00000253461 953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 STMN4-201ENST00000265770 1250 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 C11orf91-201ENST00000379011 811 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 PEMT-206ENST00000435340 960 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 FAM228B-208ENST00000613899 1238 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 RCN2-201ENST00000320963 1750 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 C6orf89-201ENST00000355190 1309 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 TRAM2-AS1-204ENST00000606714 2453 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 NPHS2-201ENST00000367615 1855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 TMEM134-202ENST00000393877 823 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 AL136090.1-201ENST00000446849 366 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 ZC3H14-219ENST00000556945 2075 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 RAB11FIP3-201ENST00000262305 4831 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 MOGS-202ENST00000409065 2668 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 NAXE-201ENST00000368233 1012 ntTSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 AC092343.1-201ENST00000500224 729 ntTSL 3 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
MTM1Q13496 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 TNFRSF25-201ENST00000348333 1119 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 TNFRSF25-202ENST00000351748 705 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
MTM1Q13496 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
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