Protein–RNA interactions for Protein: Q12441

TY1A-DR3, Transposon Ty1-DR3 Gag polyprotein, yeastyeast

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Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-DR3Q12441 GYP8YFL027C 1494 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 NAF1YNL124W 1479 nt6.01□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 MHP1YJL042W 4197 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 AEP2YMR282C 1743 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RCK2YLR248W 1833 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 TSC13YDL015C 933 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RSM18YER050C 417 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 IES5YER092W 378 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YGR161W-CYGR161W-C 279 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 AGE2YIL044C 897 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 PET130YJL023C 1044 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 ENV10YLR065C 546 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YMR052C-AYMR052C-A 366 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YMR135W-AYMR135W-A 534 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 TPP1YMR156C 717 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 GPI15YNL038W 690 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YOL163WYOL163W 510 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 MAK3YPR051W 531 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 FBP26YJL155C 1359 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RTT106YNL206C 1368 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 NOT3YIL038C 2511 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YPL247CYPL247C 1572 nt6□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 AVO1YOL078W 3531 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 ERO1YML130C 1692 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YDL032WYDL032W 312 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YDR199WYDR199W 366 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YER158W-AYER158W-A 216 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RPT6YGL048C 1218 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 BIG1YHR101C 1008 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YIL177W-AYIL177W-A 483 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YJL225W-AYJL225W-A 483 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 APN1YKL114C 1104 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RPS30AYLR287C-A 192 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YNR071CYNR071C 1029 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 CSM4YPL200W 471 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 SDA1YGR245C 2304 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YFR006WYFR006W 1608 nt5.99□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 CDC1YDR182W 1476 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 NGR1YBR212W 2019 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YCP4YCR004C 744 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YCR064CYCR064C 411 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YDR461C-AYDR461C-A 243 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 SDC1YDR469W 528 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YER010CYER010C 705 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 HEM2YGL040C 1029 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 FUR1YHR128W 651 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 CIS3YJL158C 684 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 ASG7YJL170C 630 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RDN5-2RDN5-2 119 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RDN5-3RDN5-3 119 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RDN5-4RDN5-4 119 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RDN5-5RDN5-5 119 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 GIM5YML094W 492 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 BUB3YOR026W 1026 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 ECM23YPL021W 564 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 BOP2YLR267W 1713 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 CDC37YDR168W 1521 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 PHO5YBR093C 1404 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 DLD1YDL174C 1764 nt5.98□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 ASM4YDL088C 1587 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 PRI2YKL045W 1587 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 MDM38YOL027C 1722 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 CDC50YCR094W 1176 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YAP3YHL009C 993 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 MDH1YKL085W 1005 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RPC37YKR025W 849 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 YSF3YNL138W-A 258 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 STP22YCL008C 1158 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 NUP1YOR098C 3231 nt5.97□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 RAD30YDR419W 1899 nt5.96□□□□□ -1.45
TY1A-DR3Q12441 CYS4YGR155W 1524 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 XBP1YIL101C 1944 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PLB3YOL011W 2061 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YDR381C-AYDR381C-A 345 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PEA2YER149C 1263 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YIP4YGL198W 708 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ICS3YJL077C 396 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YJL193WYJL193W 1209 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YKR011CYKR011C 1062 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPS0BYLR048W 759 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 HRI1YLR301W 735 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YOR293C-AYOR293C-A 150 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YPR074W-AYPR074W-A 171 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ASN2YGR124W 1719 nt5.96□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ATG1YGL180W 2694 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 TIP20YGL145W 2106 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YHR213WYHR213W 597 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ACF4YJR083C 930 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 RPL40BYKR094C 387 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 JLP1YLL057C 1239 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YAR062WYAR062W 597 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YMR130WYMR130W 909 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YMC1YPR058W 924 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GPX2YBR244W 489 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 ZRC1YMR243C 1329 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 PRT1YOR361C 2292 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 POP1YNL221C 2628 nt5.95□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 GDH1YOR375C 1365 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 YIL055CYIL055C 1884 nt5.94□□□□□ -1.46
TY1A-DR3Q12441 IMA5YJL216C 1746 nt5.94□□□□□ -1.46
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