Protein–RNA interactions for Protein: Q12391

TY1A-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 440 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1A-NL1Q12391 ENT1YDL161W 1365 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 VPS5YOR069W 2028 nt5.64□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 EAR1YMR171C 1653 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 BUD8YLR353W 1812 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MGT1YDL200C 567 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YDR248CYDR248C 582 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 BUD25YER014C-A 462 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 GTF1YGR102C 552 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 ECM14YHR132C 1293 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 IKI1YHR187W 930 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YPT52YKR014C 705 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YLR217WYLR217W 324 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 TAL1YLR354C 1008 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YBL059WYBL059W 582 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RPC34YNR003C 954 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YOR029WYOR029W 336 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RPS28AYOR167C 204 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RCN2YOR220W 798 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MCP1YOR228C 909 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SPE3YPR069C 882 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 CDC28YBR160W 897 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RIB5YBR256C 717 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 EXG1YLR300W 1347 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YTP1YNL237W 1380 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 KEL1YHR158C 3495 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 BIO3YNR058W 1443 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 IBA57YJR122W 1494 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 CNE1YAL058W 1509 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 NOP58YOR310C 1536 nt5.63□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 TIM22YDL217C 624 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RUB1YDR139C 234 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YDR445CYDR445C 408 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YHR127WYHR127W 732 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YIL028WYIL028W 399 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 PCL7YIL050W 858 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YLR347W-AYLR347W-A 141 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YMR193C-AYMR193C-A 387 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YNL122CYNL122C 348 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SWM2YNR004W 441 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YOL163WYOL163W 510 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 VMA4YOR332W 702 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YBR051WYBR051W 351 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 POL30YBR088C 777 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 PDR18YNR070W 4002 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 GPA1YHR005C 1419 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YGL176CYGL176C 1665 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 IXR1YKL032C 1794 nt5.62□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MRC1YCL061C 3291 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RSM10YDR041W 612 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 AFG1YEL052W 1530 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YGL041W-AYGL041W-A 465 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SNL1YIL016W 480 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 ACS1YAL054C 2142 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 DCN1YLR128W 810 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SAM37YMR060C 984 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 IRC21YMR073C 606 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YMR082CYMR082C 357 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SPS18YNL204C 903 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 ESC8YOL017W 2145 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 GPD2YOL059W 1323 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RPT4YOR259C 1314 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 TDA6YPR157W 1404 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YSY6YBR162W-A 198 nt5.61□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MSN2YMR037C 2115 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MPH3YJR160C 1809 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 MNN5YJL186W 1761 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 GDS1YOR355W 1569 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 GLO3YER122C 1482 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 Q0032Q0032 291 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YDL050CYDL050C 372 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 LCL3YGL085W 825 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 AIM39YOL053W 1188 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YCL002CYCL002C 792 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RMD9YGL107C 1941 nt5.6□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 PTC3YBL056W 1407 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 HST3YOR025W 1344 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 PEX10YDR265W 1014 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 VPS74YDR372C 1038 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YER006C-AYER006C-A 318 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 DOT5YIL010W 648 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 SYN8YAL014C 768 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 TAF9YMR236W 474 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 LEM3YNL323W 1245 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 PEX15YOL044W 1152 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 YOR268CYOR268C 399 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RET3YPL010W 570 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 GRE1YPL223C 507 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 TCM62YBR044C 1719 nt5.59□□□□□ -1.51
TY1A-NL1Q12391 RPN4YDL020C 1596 nt5.59□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 RHB1YCR027C 630 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YDR114CYDR114C 303 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 CAD1YDR423C 1230 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 WBP1YEL002C 1293 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YER181CYER181C 324 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 LOH1YJL038C 660 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 FYV7YLR068W 456 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 MRPL3YMR024W 1173 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 YMR099CYMR099C 894 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 DDR48YMR173W 1293 nt5.58□□□□□ -1.52
TY1A-NL1Q12391 IGO1YNL157W 507 nt5.58□□□□□ -1.52
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