Protein–RNA interactions for Protein: Q12216

NFI1, E3 SUMO-protein ligase SIZ2, yeastyeast

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Length 726 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
NFI1Q12216 YGR038C-AYGR038C-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YGR161C-CYGR161C-C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YJR026WYJR026W 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YJR028WYJR028W 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YAR010CYAR010C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YLR157C-AYLR157C-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YLR227W-AYLR227W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YLR256W-AYLR256W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YML040WYML040W 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YML045W-AYML045W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YMR051CYMR051C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YNL054W-AYNL054W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YOL103W-AYOL103W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YPL257W-AYPL257W-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YPR137C-AYPR137C-A 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 YPR158C-CYPR158C-C 1323 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 RRP3YHR065C 1506 nt4.41□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 DBP3YGL078C 1572 nt4.4□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 PMC1YGL006W 3522 nt4.4□□□□□ -1.7
NFI1Q12216 MRP13YGR084C 1020 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 ECM34YHL043W 513 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 COX2Q0250 756 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SWC7YLR385C 399 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 MFA2YNL145W 117 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 INA17YPL099C 549 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 ALG9YNL219C 1668 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RIM4YHL024W 2142 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RNY1YPL123C 1305 nt4.4□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 NUP2YLR335W 2163 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RTC5YOR118W 1704 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RTA1YGR213C 954 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 OAR1YKL055C 837 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YKL071WYKL071W 771 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 DSE3YOR264W 1293 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 KRE29YER038C 1395 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 ULS1YOR191W 4860 nt4.39□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SIP1YDR422C 2448 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 MIF2YKL089W 1650 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SER33YIL074C 1410 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 NTH1YDR001C 2256 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 TAF5YBR198C 2397 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)CtK(CUU)C 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)D1tK(CUU)D1 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)D2tK(CUU)D2 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)E1tK(CUU)E1 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)E2tK(CUU)E2 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)FtK(CUU)F 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)G1tK(CUU)G1 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)G2tK(CUU)G2 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)G3tK(CUU)G3 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)ItK(CUU)I 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)JtK(CUU)J 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)KtK(CUU)K 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)MtK(CUU)M 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 tK(CUU)PtK(CUU)P 73 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YNG2YHR090C 849 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SRP40YKR092C 1221 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 IES3YLR052W 753 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SRN2YLR119W 642 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YBL006W-AYBL006W-A 150 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 PAH1YMR165C 2589 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YAP1802YGR241C 1707 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 MTC1YJL123C 1437 nt4.38□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 APP1YNL094W 1764 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 NAM9YNL137C 1461 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 DNF2YDR093W 4839 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RPP1AYDL081C 321 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 TAF10YDR167W 621 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YGL188CYGL188C 174 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 LSB1YGR136W 726 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YPL199CYPL199C 723 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 ATM1YMR301C 2073 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 FMP25YLR077W 1752 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 KGD1YIL125W 3045 nt4.37□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RMD1YDL001W 1293 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RPL43BYJR094W-A 279 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 CDC42YLR229C 576 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YPR169W-AYPR169W-A 219 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YPR170W-BYPR170W-B 258 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YOL075CYOL075C 3885 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RAD30YDR419W 1899 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 GPI10YGL142C 1851 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YTM1YOR272W 1383 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 POL1YNL102W 4407 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 NMD3YHR170W 1557 nt4.36□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RNA14YMR061W 2034 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YER147C-AYER147C-A 411 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 COX4YGL187C 468 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YAR019W-AYAR019W-A 333 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YGK3YOL128C 1128 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 CKB2YOR039W 777 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 MPD1YOR288C 957 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 IDI1YPL117C 867 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RAD28YDR030C 1521 nt4.35□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 ATG2YNL242W 4779 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 RPB7YDR404C 516 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 SPI1YER150W 447 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YFL064CYFL064C 525 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 YGL132WYGL132W 336 nt4.34□□□□□ -1.71
NFI1Q12216 DAL3YIR032C 588 nt4.34□□□□□ -1.71
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