Protein–RNA interactions for Protein: Q12112

TY1B-NL1, Transposon Ty1-NL1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

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Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-NL1Q12112 PRP19YLL036C 1512 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 DIP2YLR129W 2832 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 YGR107WYGR107W 450 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 YHR180WYHR180W 492 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 APE2YKL157W 2859 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 MNN11YJL183W 1269 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 DER1YBR201W 636 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 THI7YLR237W 1797 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 ARC15YIL062C 465 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 SRB6YBR253W 366 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 VMS1YDR049W 1899 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 ECM21YBL101C 3354 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 RNH203YLR154C 333 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 ATG8YBL078C 354 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 CDS1YBR029C 1374 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 MSR1YHR091C 1932 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 USB1YLR132C 873 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 VTA1YLR181C 993 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 TAF8YML114C 1533 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 DAM1YGR113W 1032 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 PSF3YOL146W 585 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 NGL2YMR285C 1548 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-NL1Q12112 FAS2YPL231W 5664 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 BMH1YER177W 804 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 YGR051CYGR051C 324 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 MBB1YJL199C 327 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 RIM9YMR063W 720 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 RIM11YMR139W 1113 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 YBL059WYBL059W 582 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 EXO1YOR033C 2109 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 HSP82YPL240C 2130 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 PRE9YGR135W 777 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 COX23YHR116W 456 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 SHE1YBL031W 1017 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 SEG2YKL105C 3399 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 TRM1YDR120C 1713 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 YDR444WYDR444W 2064 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 BOI2YER114C 3123 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 BNA5YLR231C 1362 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 MCX1YBR227C 1563 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 FSH3YOR280C 801 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 RIM15YFL033C 5313 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 VBA1YMR088C 1689 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 PPX1YHR201C 1194 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 YBR137WYBR137W 540 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 CHD1YER164W 4407 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 EMP70YLR083C 2004 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 APC9YLR102C 798 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 EKI1YDR147W 1605 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 RPL8AYHL033C 771 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-NL1Q12112 HOM3YER052C 1584 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YPL114WYPL114W 420 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 PAM1YDR251W 2493 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 DRS2YAL026C 4068 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 PEX7YDR142C 1128 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 ECM16YMR128W 3804 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 STP22YCL008C 1158 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 AVT1YJR001W 1809 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 SAS10YDL153C 1833 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YER034WYER034W 558 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 TOS3YGL179C 1683 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 MET10YFR030W 3108 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YML020WYML020W 1995 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YTA6YPL074W 2265 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 HOM2YDR158W 1098 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YJR128WYJR128W 360 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 MIS1YBR084W 2928 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 TED1YIL039W 1422 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 EXO5YBR163W 1758 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 MRH1YDR033W 963 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 MCK1YNL307C 1128 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 CKA2YOR061W 1020 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 NIP7YPL211W 546 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 snR32snR32 188 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 IME4YGL192W 1803 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 NOP7YGR103W 1818 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 COS8YHL048W 1146 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 LEU1YGL009C 2340 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YJL175WYJL175W 513 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 COA4YLR218C 453 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 TEM1YML064C 738 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 YFL052WYFL052W 1398 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-NL1Q12112 HSP42YDR171W 1128 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 RAI1YGL246C 1164 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 MAK16YAL025C 921 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 MRPL16YBL038W 699 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 RPS9BYBR189W 588 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 YDR306CYDR306C 1437 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 ARG5,6YER069W 2592 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 RTT109YLL002W 1311 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 ECM32YER176W 3366 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 YGL108CYGL108C 423 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 REC104YHR157W 549 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 COX14YML129C 213 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 OMS1YDR316W 1416 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-NL1Q12112 BUD27YFL023W 2391 nt5.05□□□□□ -1.6
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