Protein–RNA interactions for Protein: Q12088

TY1B-LR1, Transposon Ty1-LR1 Gag-Pol polyprotein, yeastyeast

Known RBP Predictions only

Length 1,755 aa.

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Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
TY1B-LR1Q12088 PRP19YLL036C 1512 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 DIP2YLR129W 2832 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 YGR107WYGR107W 450 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 YHR180WYHR180W 492 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 APE2YKL157W 2859 nt5.25□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 MNN11YJL183W 1269 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 DER1YBR201W 636 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 THI7YLR237W 1797 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 ARC15YIL062C 465 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 YOR073W-AYOR073W-A 234 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 SRB6YBR253W 366 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 VMS1YDR049W 1899 nt5.24□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 ECM21YBL101C 3354 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 RNH203YLR154C 333 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 ATG8YBL078C 354 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 CDS1YBR029C 1374 nt5.23□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 MSR1YHR091C 1932 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 USB1YLR132C 873 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 VTA1YLR181C 993 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 TAF8YML114C 1533 nt5.22□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 DAM1YGR113W 1032 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 PSF3YOL146W 585 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 NGL2YMR285C 1548 nt5.21□□□□□ -1.57
TY1B-LR1Q12088 FAS2YPL231W 5664 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 BMH1YER177W 804 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 YGR051CYGR051C 324 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 MBB1YJL199C 327 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 RIM9YMR063W 720 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 RIM11YMR139W 1113 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 YBL059WYBL059W 582 nt5.21□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 EXO1YOR033C 2109 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 HSP82YPL240C 2130 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 PRE9YGR135W 777 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 COX23YHR116W 456 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 SHE1YBL031W 1017 nt5.2□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 SEG2YKL105C 3399 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 TRM1YDR120C 1713 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 YDR444WYDR444W 2064 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 BOI2YER114C 3123 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 BNA5YLR231C 1362 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 MCX1YBR227C 1563 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 FSH3YOR280C 801 nt5.19□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 YFR052C-AYFR052C-A 306 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 RIM15YFL033C 5313 nt5.18□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 VBA1YMR088C 1689 nt5.17□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 PPX1YHR201C 1194 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 YBR137WYBR137W 540 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 CHD1YER164W 4407 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 EMP70YLR083C 2004 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 APC9YLR102C 798 nt5.16□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 EKI1YDR147W 1605 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 RPL8AYHL033C 771 nt5.15□□□□□ -1.58
TY1B-LR1Q12088 HOM3YER052C 1584 nt5.15□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YPL114WYPL114W 420 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 PAM1YDR251W 2493 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 DRS2YAL026C 4068 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 PEX7YDR142C 1128 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 ECM16YMR128W 3804 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 STP22YCL008C 1158 nt5.14□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 AVT1YJR001W 1809 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 SAS10YDL153C 1833 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YER034WYER034W 558 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 TOS3YGL179C 1683 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 MET10YFR030W 3108 nt5.13□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YML020WYML020W 1995 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YTA6YPL074W 2265 nt5.12□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 HOM2YDR158W 1098 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YJR128WYJR128W 360 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 MIS1YBR084W 2928 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 TED1YIL039W 1422 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 EXO5YBR163W 1758 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 MRH1YDR033W 963 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 tF(GAA)DtF(GAA)D 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 tF(GAA)NtF(GAA)N 73 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 MCK1YNL307C 1128 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 CKA2YOR061W 1020 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 NIP7YPL211W 546 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 snR32snR32 188 nt5.11□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 IME4YGL192W 1803 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 NOP7YGR103W 1818 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 COS8YHL048W 1146 nt5.1□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 LEU1YGL009C 2340 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YJL175WYJL175W 513 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 COA4YLR218C 453 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 TEM1YML064C 738 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 YFL052WYFL052W 1398 nt5.09□□□□□ -1.59
TY1B-LR1Q12088 HSP42YDR171W 1128 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 RAI1YGL246C 1164 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 MAK16YAL025C 921 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 MRPL16YBL038W 699 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 RPS9BYBR189W 588 nt5.09□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 YDR306CYDR306C 1437 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 ARG5,6YER069W 2592 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 RTT109YLL002W 1311 nt5.08□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 ECM32YER176W 3366 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 YGL108CYGL108C 423 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 REC104YHR157W 549 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 COX14YML129C 213 nt5.06□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 OMS1YDR316W 1416 nt5.05□□□□□ -1.6
TY1B-LR1Q12088 BUD27YFL023W 2391 nt5.05□□□□□ -1.6
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