Protein–RNA interactions for Protein: Q08174

PCDH1, Protocadherin-1, humanhuman

Predictions only

Length 1,060 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PCDH1Q08174 CCDC9-201ENST00000221922 2093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 CLYBL-202ENST00000376354 1127 ntTSL 5 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ERRFI1-204ENST00000474874 479 ntTSL 3 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 TLX3-201ENST00000296921 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 IDH2-202ENST00000540499 1453 ntTSL 2 BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 CORO1A-201ENST00000219150 1803 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.43■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 DGAT2-201ENST00000228027 2453 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 MXRA7-201ENST00000355797 5661 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 RGS6-209ENST00000553525 2005 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 MIR3621-201ENST00000580529 85 ntBASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.42■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 DOK1-203ENST00000409429 1955 ntTSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 TMEM268-202ENST00000374049 4578 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 SDSL-202ENST00000403593 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ADRM1-205ENST00000620230 1361 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 CLPSL2-202ENST00000403376 405 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 AP002893.1-201ENST00000528885 684 ntTSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 AC009086.3-201ENST00000623486 1008 ntBASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.41■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 CMPK2-202ENST00000404168 2042 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 SLC35F4-206ENST00000556826 1908 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 RALB-201ENST00000272519 2344 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 NAE1-204ENST00000394074 1654 ntTSL 5 BASIC21.4■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 WDR86-208ENST00000628331 1905 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.02
PCDH1Q08174 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SPAG16-201ENST00000272898 1059 ntTSL 5 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.39■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 PICSAR-201ENST00000615826 733 ntTSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC241377.3-202ENST00000626088 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC241585.3-202ENST00000628937 1088 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC245100.8-202ENST00000629247 1058 ntBASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 BEST2-204ENST00000553030 2000 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 CCZ1B-201ENST00000316731 2885 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.38■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 METTL21A-210ENST00000458426 1366 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 P2RX2-205ENST00000352418 1200 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 ADAMTS13-203ENST00000371910 1074 ntTSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SLC25A39-203ENST00000537904 1274 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 OIP5-AS1-208ENST00000560706 473 ntTSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 RNF225-201ENST00000601382 990 ntAPPRIS P1 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 ANKS6-201ENST00000353234 7164 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 GFRA4-201ENST00000290417 1427 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.37■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 AC127496.7-201ENST00000625110 1798 ntBASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 TRAPPC5-202ENST00000426877 765 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 TMEM80-207ENST00000608174 800 ntTSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.36■■□□□ 1.01
PCDH1Q08174 MADCAM1-205ENST00000613880 1509 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.35■■□□□ 1.01
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 30.9 ms