Protein–RNA interactions for Protein: Q01954

BNC1, Zinc finger protein basonuclin-1, humanhuman

Predictions only

Length 994 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
BNC1Q01954 SIMC1-204ENST00000430704 1925 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 ZFAND2B-202ENST00000409097 1765 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 ARSB-206ENST00000565165 1772 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SLC22A18-201ENST00000312221 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 BIN1-206ENST00000352848 2209 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SRR-201ENST00000344595 2728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 FEZ2-203ENST00000379245 2097 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 CAPZB-203ENST00000375142 1686 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 NINJ1-201ENST00000375446 1281 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 STOML2-202ENST00000452248 1296 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 STOML2-205ENST00000619795 1293 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.13
BNC1Q01954 SOHLH1-201ENST00000298466 1987 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 DYRK1B-201ENST00000323039 2535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SPPL2B-211ENST00000614794 1559 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 ZNF365-206ENST00000395255 1674 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AC006455.5-202ENST00000615248 2284 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 IPO9-AS1-201ENST00000413035 839 ntTSL 3 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 CKLF-205ENST00000417030 628 ntAPPRIS ALT2 TSL 4 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AL354811.1-201ENST00000610286 706 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SHMT1-203ENST00000354098 1656 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 ACP1-201ENST00000272065 1549 ntAPPRIS P5 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 LINC02043-201ENST00000419745 1832 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 KRT72-203ENST00000537672 1813 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 OTUB1-212ENST00000543988 1259 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 MAF-202ENST00000393350 6384 ntAPPRIS ALT2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 PLD4-201ENST00000392593 6515 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 PLPP1-201ENST00000264775 1550 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AC091230.1-202ENST00000564823 5356 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 MLNR-201ENST00000218721 1239 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 EGR4-201ENST00000436467 2377 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 NECTIN2-202ENST00000252485 2112 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 EZH2-206ENST00000478654 2522 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 CDKN2AIPNL-201ENST00000395009 800 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 GLI4-210ENST00000523522 1297 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 HTATIP2-201ENST00000419348 1477 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
BNC1Q01954 BDH1-207ENST00000441275 1605 ntTSL 5 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 TMEM221-201ENST00000341130 1930 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 AUTS2-203ENST00000406775 5950 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ADGRA2-202ENST00000412232 5651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 PSIP1-202ENST00000380716 1889 ntTSL 5 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 EHBP1L1-201ENST00000309295 5185 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RTL8C-201ENST00000257013 1181 ntAPPRIS P1 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 E2F5-203ENST00000418930 1890 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22■■□□□ 1.11
BNC1Q01954 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC22■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 44.4 ms