Protein–RNA interactions for Protein: Q00597

FANCC, Fanconi anemia group C protein, humanhuman

Predictions only

Length 558 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
FANCCQ00597 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC24.56■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 FKBP1B-202ENST00000380991 1010 ntTSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.55■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 DHRS11-215ENST00000618403 1598 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SSX2IP-203ENST00000437941 5843 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 GAS2L1-207ENST00000611648 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 TMEM9B-205ENST00000534025 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 PPP1R14A-201ENST00000301242 777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC24.54■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 NAT8L-202ENST00000423729 5870 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 MAGI2-217ENST00000629359 6704 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 LIMS2-201ENST00000324938 2111 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 SLC22A31-201ENST00000562855 1909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.53■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 BID-212ENST00000614949 1988 ntTSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 ASRGL1-201ENST00000301776 2182 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
FANCCQ00597 CDC14B-202ENST00000375241 5589 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 KIF12-202ENST00000468460 2162 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 UPF3A-202ENST00000375299 2387 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 DPH7-201ENST00000277540 1847 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 FAM171A2-201ENST00000293443 3160 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 MSL1-204ENST00000578648 2267 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 NKX6-3-201ENST00000518699 1352 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 DUX4-203ENST00000565211 1710 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 DNAJB11-202ENST00000439351 2398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 ITGB1BP1-203ENST00000359712 2126 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 ZSCAN18-217ENST00000601144 2190 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 AOC3-207ENST00000617500 2392 ntTSL 4 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 SLC35A3-210ENST00000638371 2298 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
FANCCQ00597 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 YY1AP1-214ENST00000407221 2705 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
FANCCQ00597 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.4 ms