Protein–RNA interactions for Protein: P98172

EFNB1, Ephrin-B1, humanhuman

Predictions only

Length 346 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
EFNB1P98172 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ZNF784-201ENST00000325351 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 RUNDC3B-207ENST00000493037 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 SRP68-201ENST00000307877 2649 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.99■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 JUNB-201ENST00000302754 1820 ntAPPRIS P1 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.98■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 SCLY-201ENST00000254663 2562 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 TARBP2-201ENST00000266987 1867 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 AL024507.2-201ENST00000606070 2574 ntBASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 LACTBL1-201ENST00000426928 1641 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC19.97■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 NREP-216ENST00000508870 540 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 CRHR1-201ENST00000293493 2621 ntTSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 ZSWIM6-201ENST00000252744 5501 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 BAALC-205ENST00000438105 2662 ntTSL 1 (best) BASIC19.96■□□□□ 0.79
EFNB1P98172 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 SMOX-212ENST00000621355 2322 ntTSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PLA2G10-201ENST00000438167 1000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.95■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PACRGL-201ENST00000295290 1937 ntTSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CT47A7-201ENST00000434883 1288 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 KCNMA1-283ENST00000640523 5425 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 TMEM198B-205ENST00000487582 1581 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.94■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 C7orf49-203ENST00000430372 1579 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 EGFL8-220ENST00000395512 1312 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 KIF12-207ENST00000640217 2194 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC19.93■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CREB3L3-205ENST00000602257 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC026310.3-201ENST00000625186 2373 ntBASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 ANKRD44-204ENST00000409919 1622 ntTSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 MT2A-201ENST00000245185 786 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC105935.1-201ENST00000424174 422 ntTSL 3 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 ZNF410-206ENST00000540593 1722 ntTSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CRLF1-201ENST00000392386 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 SLC19A1-212ENST00000567670 2029 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.92■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 AC133065.2-201ENST00000573379 2147 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 MMEL1-206ENST00000502556 1943 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.91■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 C7orf25-201ENST00000350427 2451 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 E2F1-201ENST00000343380 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.9■□□□□ 0.78
EFNB1P98172 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC19.9■□□□□ 0.78
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26.3 ms