Protein–RNA interactions for Protein: P68543

UBXN2A, UBX domain-containing protein 2A, humanhuman

Predictions only

Length 259 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
UBXN2AP68543 GTF2IP1-204ENST00000616377 2632 ntTSL 2 BASIC25.78■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 VGF-203ENST00000611537 1622 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AP000802.1-201ENST00000500537 1934 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 AP001107.5-202ENST00000533759 948 ntTSL 5 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 PMS1-205ENST00000409985 1882 ntTSL 2 BASIC25.77■■□□□ 1.72
UBXN2AP68543 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ZFYVE28-207ENST00000509171 1135 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TMEM41B-205ENST00000533723 723 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TK2-208ENST00000545043 1120 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 AC007773.1-201ENST00000592680 972 ntTSL 2 BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 AC004812.2-201ENST00000611079 2094 ntBASIC25.76■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 PACS2-201ENST00000325438 3708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 UXS1-201ENST00000283148 2099 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 GP1BB-201ENST00000366425 1553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.75■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 C12orf75-208ENST00000612117 1329 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ME3-201ENST00000323418 1068 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 CAMKMT-202ENST00000402247 665 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 PRKCQ-AS1-204ENST00000455810 920 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 AL691442.1-201ENST00000505139 1042 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ST7L-221ENST00000490067 1780 ntTSL 1 (best) BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC25.74■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ADIPOR1-201ENST00000340990 2177 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 LINC00543-201ENST00000567234 1845 ntBASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 HES6-202ENST00000409002 1286 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 AL355877.1-204ENST00000451482 1078 ntTSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ODF3L2-201ENST00000315489 1604 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.73■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 POMZP3-202ENST00000310842 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TRAF4-205ENST00000444415 1456 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 NUDT18-202ENST00000613958 1754 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ZNRF1-201ENST00000320619 2479 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 UBE2C-202ENST00000335046 737 ntTSL 2 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 NXNL2-201ENST00000375854 805 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 NDUFA6-AS1-207ENST00000595777 833 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 SETD9-201ENST00000285947 1619 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 CYS1-201ENST00000381813 2738 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.72■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 PLEKHA8-202ENST00000396257 1907 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 SHD-204ENST00000599689 1729 ntTSL 5 BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC25.71■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 ITM2C-203ENST00000335005 1889 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 HAUS7-202ENST00000370211 1363 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 AF117829.1-201ENST00000519655 1398 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.71
UBXN2AP68543 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 AKT1-203ENST00000407796 2710 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 FUS-210ENST00000568685 1785 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 AC011825.4-201ENST00000582233 473 ntTSL 2 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ENTPD5-206ENST00000556242 1437 ntTSL 5 BASIC25.7■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 BTBD7-201ENST00000298896 2621 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ST3GAL4-213ENST00000530591 1459 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 POLR2H-204ENST00000438240 994 ntTSL 3 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 SSPN-204ENST00000535504 419 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 MCRIP1-205ENST00000572645 1038 ntTSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 ASPSCR1-211ENST00000581647 720 ntTSL 2 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 PREB-202ENST00000406567 1910 ntTSL 5 BASIC25.69■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC25.68■■□□□ 1.7
UBXN2AP68543 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC25.68■■□□□ 1.7
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.1 ms