Protein–RNA interactions for Protein: P61024

CKS1B, Cyclin-dependent kinases regulatory subunit 1, humanhuman

Predictions only

Length 79 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CKS1BP61024 PARP9-207ENST00000492382 1837 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FBXO41-205ENST00000521871 7336 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FAHD1-203ENST00000427358 1974 ntAPPRIS P1 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CACNA1A-247ENST00000637769 8648 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FAM86JP-203ENST00000485843 2012 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 SNTB2-201ENST00000336278 9789 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MARCH8-201ENST00000319836 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 BCR-202ENST00000359540 4708 ntTSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FUT11-201ENST00000372841 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 C10orf55-202ENST00000412307 2360 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 KANSL1-218ENST00000638275 5352 ntTSL 5 BASIC15.39■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ZNF213-201ENST00000396878 3313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MTA1-201ENST00000331320 2876 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MAP6D1-201ENST00000318631 2111 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 BCL7A-203ENST00000538010 6247 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TSEN15-201ENST00000361641 1960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 SLC39A2-201ENST00000298681 1379 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 JAK2-201ENST00000381652 5285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FGFR2-224ENST00000613048 4369 ntTSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 PNMA8B-202ENST00000599531 5308 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 DENND1A-203ENST00000373624 5010 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 PRKACA-201ENST00000308677 2677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CACNA1A-214ENST00000614285 8410 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 C1orf122-201ENST00000373042 973 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 HES4-202ENST00000428771 1040 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 WWC1-201ENST00000265293 7130 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 NPAS1-208ENST00000602212 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 RASL10A-201ENST00000216101 1490 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FLT1-201ENST00000282397 7092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC15.38■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 RNPEP-201ENST00000295640 2427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CEBPA-201ENST00000498907 2631 ntAPPRIS P1 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 SELENOO-203ENST00000611222 2311 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ACBD4-214ENST00000591859 1998 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 GFER-205ENST00000569451 517 ntTSL 5 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TSR3-201ENST00000007390 1243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FAM20C-201ENST00000313766 2751 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 GRB10-201ENST00000335866 5032 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 PCDHAC2-201ENST00000289269 5963 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CLK3-202ENST00000395066 2621 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 BCL2L12-212ENST00000616144 1854 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 NEU4-205ENST00000407683 2273 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 PPTC7-201ENST00000354300 4996 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 GAL3ST3-201ENST00000312006 2133 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 SELENOO-201ENST00000380903 2315 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TLX1-201ENST00000370196 2906 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.37■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 RRAD-201ENST00000299759 1569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 NFE2L3P1-201ENST00000588207 1959 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 HOXA11-201ENST00000006015 2295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MYL5-206ENST00000506838 2956 ntTSL 2 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MIR7108-201ENST00000614319 87 ntBASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CKB-201ENST00000348956 1709 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 LGALS9B-202ENST00000423676 1713 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 DTNB-210ENST00000407186 2275 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ARHGAP23-222ENST00000622683 5964 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC15.36■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 SMOC2-206ENST00000535039 1875 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TMEM214-203ENST00000404032 2830 ntTSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ADCY5-202ENST00000462833 7311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 C18orf8-214ENST00000615148 1958 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ARID1B-203ENST00000350026 7962 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 PLEKHB1-201ENST00000227214 2016 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 HSPBP1-202ENST00000433386 1572 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ZNF263-204ENST00000573578 1636 ntTSL 5 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CENPVL1-201ENST00000602548 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 CENPVL2-201ENST00000634648 1620 ntAPPRIS P1 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 VSTM4-201ENST00000298454 2170 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FRRS1L-201ENST00000561981 8197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ARHGAP35-201ENST00000404338 8889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.35■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TSPAN4-203ENST00000397397 1423 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TMEM259-201ENST00000333175 2581 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 HSD11B1L-206ENST00000423665 1525 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 B3GNT2-201ENST00000301998 2763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TMTC1-203ENST00000539277 2758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 FLYWCH1-201ENST00000253928 5037 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MIR639-201ENST00000384974 98 ntBASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TMEM114-202ENST00000568335 899 ntTSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 MID1IP1-203ENST00000457894 1902 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC15.34■□□□□ 0.05
CKS1BP61024 TRABD-201ENST00000303434 2329 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC15.34■□□□□ 0.05
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17.5 ms