Protein–RNA interactions for Protein: P58294

PROK1, Prokineticin-1, humanhuman

Predictions only

Length 105 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PROK1P58294 PABPN1-202ENST00000397276 2768 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 INS-202ENST00000381330 597 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ZNF837-201ENST00000427624 2038 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.43■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SHD-201ENST00000543264 2577 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.42■□□□□ 0.38
PROK1P58294 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ATG16L2-201ENST00000321297 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 CCND3-202ENST00000372988 2133 ntTSL 1 (best) BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 TMEM64-201ENST00000418210 4663 ntTSL 2 BASIC17.41■□□□□ 0.38
PROK1P58294 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.4■□□□□ 0.38
PROK1P58294 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC17.39■□□□□ 0.38
PROK1P58294 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.38
PROK1P58294 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.39■□□□□ 0.37
PROK1P58294 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 AC243773.2-201ENST00000616341 490 ntTSL 2 BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 DISC1-224ENST00000639374 1071 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.38■□□□□ 0.37
PROK1P58294 XBP1-207ENST00000611155 1794 ntTSL 5 BASIC17.38■□□□□ 0.37
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 14.6 ms