Protein–RNA interactions for Protein: P56278

MTCP1, Protein p13 MTCP-1, humanhuman

Predictions only

Length 107 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
MTCP1P56278 CBWD3-213ENST00000618217 1611 ntTSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.1■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC19.1■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 ZBTB46-202ENST00000302995 2335 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 RPP38-201ENST00000378197 1457 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 ARSB-201ENST00000264914 5327 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 FGF22-201ENST00000215530 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 NRG3-201ENST00000372141 2158 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 STK25-234ENST00000535007 2459 ntTSL 2 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 PARD3-208ENST00000374789 6005 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 GPSM1-204ENST00000429455 2057 ntTSL 3 BASIC19.09■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 SESN3-202ENST00000416495 1408 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 CAPN12-212ENST00000601953 2381 ntTSL 5 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 TTC7A-201ENST00000319190 5157 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 LTB4R-201ENST00000345363 1616 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 UBE3C-209ENST00000611269 1866 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.65
MTCP1P56278 AC026785.2-201ENST00000511821 867 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 BAZ1A-202ENST00000360310 6010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 KCNK12-201ENST00000327876 6227 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 TPI1-210ENST00000613953 1460 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 KIF2A-202ENST00000401507 2539 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 EYA2-203ENST00000357410 2465 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 FOSL1-202ENST00000448083 1427 ntTSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RPS6KA2-201ENST00000265678 5824 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 TULP1-202ENST00000322263 1941 ntTSL 1 (best) BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC19.08■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 CELF5-201ENST00000292672 1854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RBAK-202ENST00000396912 6551 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 CNR1-203ENST00000369501 6031 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 AP006623.1-201ENST00000506172 2061 ntTSL 5 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 MSL1-203ENST00000577454 2081 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 GRIK4-205ENST00000527524 5861 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ZNF395-210ENST00000523095 1790 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 AC090587.2-201ENST00000430222 527 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 FAM72B-203ENST00000452190 748 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 PRR7-204ENST00000510492 1285 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 PRTG-204ENST00000561292 833 ntTSL 3 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 AC009163.4-201ENST00000567194 530 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 LSM7-204ENST00000587502 575 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ZNF503-AS2-202ENST00000466942 1430 ntTSL 2 BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 DENND4B-201ENST00000361217 5706 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 AC004980.1-201ENST00000418663 2667 ntTSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.07■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 FBXW7-202ENST00000281708 4976 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ZFAND5-202ENST00000343431 1073 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RNF146-205ENST00000477776 762 ntTSL 3 BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ACOT1-202ENST00000557556 1271 ntTSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 CLDND1-202ENST00000394180 2228 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC19.06■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 G6PD-202ENST00000393562 2631 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 G6PD-211ENST00000621232 2631 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 POLR2J2-202ENST00000358438 2065 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 AC112229.4-201ENST00000488671 1528 ntTSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RBM42-206ENST00000592202 1469 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 TPM4-201ENST00000300933 2666 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 SRPK3-202ENST00000370101 1958 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ZFP69B-204ENST00000484445 1976 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 EBPL-205ENST00000378284 967 ntTSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 KRT125P-201ENST00000546827 989 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 TDRKH-206ENST00000440583 2296 ntTSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RNF39-201ENST00000244360 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 DPH1-203ENST00000570477 1747 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 LINC00526-201ENST00000581067 1875 ntBASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 KCNIP1-201ENST00000328939 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.05■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 MTCL1-201ENST00000306329 5718 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 RIOX1-201ENST00000304061 2429 ntAPPRIS P1 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 REV1-201ENST00000258428 4751 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ECEL1P1-201ENST00000373592 1742 ntBASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 CHAC1-201ENST00000444189 1204 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 PTPN13-205ENST00000502971 1708 ntTSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 FNDC4-201ENST00000264703 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC19.04■□□□□ 0.64
MTCP1P56278 SYNDIG1-201ENST00000376862 2522 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC19.04■□□□□ 0.64
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23.1 ms