Protein–RNA interactions for Protein: P52742

ZNF135, Zinc finger protein 135, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 658 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
ZNF135P52742 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 FAM193A-211ENST00000637812 4885 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 FPGS-204ENST00000393706 2230 ntTSL 2 BASIC22.89■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 GRK4-204ENST00000503518 2136 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CTDSPL-206ENST00000443503 4640 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC096677.1-201ENST00000454651 1516 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 HAS1-201ENST00000222115 2087 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 MIR4466-201ENST00000606121 54 ntBASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC098864.1-205ENST00000315302 2260 ntTSL 2 BASIC22.88■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 STOML1-201ENST00000316900 2169 ntTSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 WRNIP1-205ENST00000618555 2651 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 MPND-202ENST00000359935 1475 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 KCTD8-201ENST00000360029 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AL138724.1-201ENST00000606771 1088 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 HYAL2-207ENST00000442581 2318 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 ESRRAP2-201ENST00000418437 1549 ntBASIC22.87■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 C11orf95-202ENST00000433688 5716 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 ABHD6-205ENST00000478253 2482 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 ME2-208ENST00000638937 2471 ntTSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.86■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 DMRT2-209ENST00000635183 2190 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 ASPSCR1-201ENST00000306729 2123 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.85■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 WDR86-AS1-204ENST00000489632 751 ntTSL 3 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 pRNA.6-201ENST00000610482 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 pRNA.5-201ENST00000612139 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 pRNA.11-201ENST00000618423 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 pRNA.13-201ENST00000619112 90 ntBASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CCSER2-202ENST00000359979 2066 ntTSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 CASP9-203ENST00000375890 1351 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 NPEPL1-201ENST00000356091 2378 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.84■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 KLHL36-201ENST00000258157 1974 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 ZPBP2-201ENST00000348931 1543 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 TBX1-203ENST00000359500 1538 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 RARA-202ENST00000394081 2285 ntTSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 TMEM64-203ENST00000458549 4997 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 SLC39A14-202ENST00000289952 2137 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 KRTAP5-4-201ENST00000399682 1181 ntAPPRIS P5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 LINGO3-201ENST00000585527 2241 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 KLC1-227ENST00000634686 2229 ntTSL 5 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 AC233992.2-201ENST00000531225 1596 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.83■■□□□ 1.25
ZNF135P52742 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.83■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 THRA-209ENST00000584985 2421 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 AC007009.1-201ENST00000458624 429 ntTSL 2 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 COG8-201ENST00000562081 1731 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 AC133637.1-201ENST00000624115 1537 ntBASIC22.82■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 IQCD-203ENST00000546692 1872 ntTSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 THRA-201ENST00000264637 2538 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 MAZ-201ENST00000219782 2698 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 MIR3181-201ENST00000578512 73 ntBASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 CEBPD-201ENST00000408965 2178 ntAPPRIS P1 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 DENND2D-202ENST00000369752 1894 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.81■■□□□ 1.24
ZNF135P52742 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.8■■□□□ 1.24
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.7 ms