Protein–RNA interactions for Protein: P48788

TNNI2, Troponin I, fast skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 182 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNI2P48788 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 FAM181A-204ENST00000557000 1652 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 ZFPM1-201ENST00000319555 5380 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.59■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 AC135731.1-201ENST00000569415 2548 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 POLR2E-214ENST00000619917 932 ntTSL 5 BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 HECA-201ENST00000367658 5614 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.58■■□□□ 1.85
TNNI2P48788 SH3RF3-AS1-201ENST00000567491 1604 ntBASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 PRMT2-204ENST00000397628 954 ntTSL 2 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 PKIB-204ENST00000368448 1561 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 IL17RE-203ENST00000421412 2158 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC26.57■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AL391650.1-201ENST00000448923 1468 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SLC35A3-213ENST00000638988 1286 ntTSL 5 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.56■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 NRG1-210ENST00000520407 1955 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SCN1B-206ENST00000638536 1600 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 C1QTNF4-201ENST00000302514 1664 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 ATP6V0E2-204ENST00000464662 513 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 CDH23-206ENST00000398842 1759 ntTSL 5 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 TNIP2-206ENST00000510267 2006 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC26.55■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SLC35A2-210ENST00000616181 1614 ntTSL 2 BASIC26.54■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 HDGFL2-210ENST00000621835 2255 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 FAM102B-202ENST00000405454 1585 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 STK19-201ENST00000375331 1663 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 JAG2-202ENST00000347004 5720 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.53■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 CIRBP-222ENST00000589235 1073 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 CCNG2-201ENST00000316355 5526 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.52■■□□□ 1.84
TNNI2P48788 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TADA2B-201ENST00000310074 4350 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC26.51■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TBC1D10A-201ENST00000215790 2077 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.5■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 ST6GALNAC2-201ENST00000225276 2170 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC26.49■■□□□ 1.83
TNNI2P48788 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC26.49■■□□□ 1.83
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 27.4 ms