Protein–RNA interactions for Protein: P48052

CPA2, Carboxypeptidase A2, humanhuman

Predictions only

Length 419 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CPA2P48052 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CCDC24-201ENST00000372318 1463 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PLPP5-209ENST00000529359 2185 ntTSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 KRT18P10-201ENST00000388836 1287 ntBASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 NAT14-201ENST00000205194 1536 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.73■■□□□ 1.07
CPA2P48052 SUMF1-201ENST00000272902 2159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 GPSM1-206ENST00000616132 2270 ntTSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 POC1B-209ENST00000549035 2038 ntTSL 2 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ZNF48-201ENST00000320159 3234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PALM-202ENST00000338448 2725 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ARFGAP3-201ENST00000263245 2857 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 TRIM54-202ENST00000380075 1967 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.72■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PHF7-201ENST00000327906 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CRHR1-202ENST00000314537 2535 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 BHLHE23-202ENST00000612929 1109 ntBASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 KCNIP2-207ENST00000358038 2489 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 FBXL19-205ENST00000562319 2462 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 RHCE-204ENST00000349320 1810 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 GRM6-201ENST00000231188 6143 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 SYT7-201ENST00000263846 4854 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.71■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CPA2P48052 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.07
CPA2P48052 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LOXL1-AS1-210ENST00000567257 2358 ntTSL 2 BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPA2P48052 CNTFR-202ENST00000378980 2052 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.7■■□□□ 1.06
CPA2P48052 C14orf80-204ENST00000392522 1630 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 EI24-204ENST00000527235 1625 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 CD63-202ENST00000420846 981 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 ILDR2-208ENST00000529387 1238 ntTSL 5 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 SEC11C-204ENST00000587834 1202 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 ZNF331-202ENST00000411977 2248 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 CHST7-201ENST00000276055 2289 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 PPP4C-201ENST00000279387 1407 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 HOXC8-201ENST00000040584 1889 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.69■■□□□ 1.06
CPA2P48052 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 TEX22-201ENST00000451127 2571 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 DUX4L9-201ENST00000449051 1259 ntBASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 ERFE-207ENST00000546354 1065 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 SERINC5-203ENST00000509193 1441 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 TTLL1-201ENST00000266254 1645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 UFD1-201ENST00000263202 1814 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 MAG-202ENST00000392213 2390 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 MAPK9-203ENST00000393360 4326 ntTSL 5 BASIC21.68■■□□□ 1.06
CPA2P48052 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 AP005233.1-201ENST00000562341 2424 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 GPR137B-202ENST00000366592 2042 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 GNS-207ENST00000542058 2020 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 TSPY4-202ENST00000426950 1179 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LYSMD2-202ENST00000454181 1228 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 RARRES2P1-201ENST00000474487 481 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 UBE2E3-213ENST00000602959 909 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 DBX2-201ENST00000332700 2806 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 COMT-202ENST00000361682 2437 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 THEM6-201ENST00000336138 2259 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 PPP3CC-201ENST00000240139 2189 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 DOCK5-208ENST00000481100 2166 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC21.67■■□□□ 1.06
CPA2P48052 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPA2P48052 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.66■■□□□ 1.06
CPA2P48052 CDV3-201ENST00000264993 3307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPA2P48052 FAM159A-204ENST00000517870 748 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
CPA2P48052 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.66■■□□□ 1.06
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 36.5 ms