Protein–RNA interactions for Protein: P47878

Igfbp3, Insulin-like growth factor-binding protein 3, mousemouse

Predictions only

Length 292 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (Experimental data)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
Igfbp3P47878 Agap3-205ENSMUST00000199856 2685 ntTSL 5 BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Upf1-201ENSMUST00000075666 4618 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Csnk1e-203ENSMUST00000122044 3174 ntTSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Ssx2ip-201ENSMUST00000039021 3410 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Gm3558-201ENSMUST00000163790 2055 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Pgf-204ENSMUST00000223220 2080 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.35■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Clip1-205ENSMUST00000111566 6133 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Gm15546-201ENSMUST00000122095 826 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Papola-212ENSMUST00000168186 2436 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Gm19439-201ENSMUST00000198195 2273 ntBASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Zfp821-206ENSMUST00000212964 2033 ntTSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Rbfa-201ENSMUST00000025462 1377 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Foxj1-201ENSMUST00000036215 2623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.34■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Pitx1-201ENSMUST00000021968 2451 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 U2af2-209ENSMUST00000209099 2088 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Btbd6-204ENSMUST00000221104 2085 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Aebp2-202ENSMUST00000087614 3727 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Serbp1-207ENSMUST00000203436 1667 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.37
Igfbp3P47878 Pex7-203ENSMUST00000166511 1047 ntTSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Hoxc11-201ENSMUST00000001701 2021 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Phospho1-201ENSMUST00000054173 1910 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Mfsd14a-201ENSMUST00000029570 2782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Sox10-201ENSMUST00000040019 2713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Btbd17-201ENSMUST00000000206 1717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.33■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Grk6-206ENSMUST00000224995 2971 ntBASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Abhd11-201ENSMUST00000046999 1493 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Bmpr1b-202ENSMUST00000098568 1910 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Rin3-207ENSMUST00000150795 937 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Pcf11-204ENSMUST00000208058 461 ntTSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Clcn4-206ENSMUST00000210594 2539 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Hdgfl3-201ENSMUST00000026094 2865 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Klhl32-201ENSMUST00000084781 2287 ntTSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Pigw-201ENSMUST00000067058 2675 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.32■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Spata2-202ENSMUST00000109211 1531 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm7628-201ENSMUST00000134690 2010 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Palm-202ENSMUST00000105379 2519 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 2410002F23Rik-201ENSMUST00000055858 1982 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Pqlc1-201ENSMUST00000070135 1911 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Fbxl5-201ENSMUST00000047857 2858 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Shisa8-201ENSMUST00000179269 1804 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Setd4-201ENSMUST00000023669 1816 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Lgr4-202ENSMUST00000111037 4988 ntTSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Aen-202ENSMUST00000107423 2230 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 C1qtnf5-203ENSMUST00000114818 1337 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 B4galt4-205ENSMUST00000114712 2168 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm5522-201ENSMUST00000189483 1242 ntBASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Avl9-203ENSMUST00000177249 1614 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Slc30a4-202ENSMUST00000099457 3170 ntTSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Fgf3-201ENSMUST00000105898 2299 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Hpdl-201ENSMUST00000055436 1804 ntAPPRIS P1 BASIC17.31■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Trim47-202ENSMUST00000106441 2192 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Ehmt2-203ENSMUST00000097342 3934 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Vim-206ENSMUST00000193675 1777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Lhfp-201ENSMUST00000059562 2108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Fastk-202ENSMUST00000115041 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Vps26a-201ENSMUST00000092473 2712 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm44832-201ENSMUST00000208849 2303 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Plin5-202ENSMUST00000113072 1986 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Eomes-202ENSMUST00000111763 2869 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm13238-201ENSMUST00000117655 780 ntBASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm16599-201ENSMUST00000148082 1182 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm26798-201ENSMUST00000181384 2837 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Anks1b-217ENSMUST00000182550 1868 ntTSL 5 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Pdss1-207ENSMUST00000152170 1538 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Tusc3-201ENSMUST00000167992 1511 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Larp1b-202ENSMUST00000048490 2354 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Mtus2-205ENSMUST00000110515 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm2415-201ENSMUST00000128982 1474 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Llph-202ENSMUST00000130198 1463 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Syncrip-205ENSMUST00000173801 2944 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 A530010L16Rik-201ENSMUST00000212007 2336 ntTSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Zbtb8a-201ENSMUST00000030610 2321 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.3■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm26884-201ENSMUST00000181207 3074 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Tmem55b-205ENSMUST00000160835 2755 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Hrh3-205ENSMUST00000165762 1368 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 March2-203ENSMUST00000172767 1381 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Zfp287-205ENSMUST00000150336 1605 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Mtmr14-201ENSMUST00000113146 2676 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Ppp3ca-202ENSMUST00000070198 4758 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Brms1l-201ENSMUST00000059250 2609 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Lhx8-201ENSMUST00000177846 2076 ntTSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Atp8a1-203ENSMUST00000113651 808 ntTSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Eif5a-213ENSMUST00000164359 1281 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Cep78-201ENSMUST00000047704 2548 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Herpud2-201ENSMUST00000008573 2781 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Sirt1-202ENSMUST00000105442 3740 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Sfrp5-201ENSMUST00000018966 1900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Map4k3-201ENSMUST00000025089 4225 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC17.29■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Trp73-204ENSMUST00000105644 5042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 2310022A10Rik-201ENSMUST00000067386 2701 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Sqstm1-201ENSMUST00000015981 2673 ntTSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Ccdc3-201ENSMUST00000027988 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm4779-203ENSMUST00000147742 1991 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Tbc1d10a-201ENSMUST00000041042 1957 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Rpl34-201ENSMUST00000062601 624 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Nhlh1-201ENSMUST00000059794 2464 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Pgs1-203ENSMUST00000132676 2863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Gm45606-201ENSMUST00000209836 2795 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 4930500M09Rik-202ENSMUST00000194988 1563 ntBASIC17.28■□□□□ 0.36
Igfbp3P47878 Fance-201ENSMUST00000088007 1581 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC17.28■□□□□ 0.36
Retrieved 100 of 76,532 protein–RNA pairs in 21.1 ms