Protein–RNA interactions for Protein: P42843

SKP2, F-box protein SKP2, yeast

Predictions only

Length 763 aa.

Protein		RNA				Prediction (catRAPID)		Interaction (RIP-Chip)
Gene	UniProt Accession	Gene	Ensembl Transcript ID	Length	Transcript Status	Prediction Score	Prediction z-Score	Detected Interaction
SKP2	P42843	PDX3	YBR035C	687 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YOR379C	YOR379C	339 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	PEX34	YCL056C	435 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	TDA11	YHR159W	1515 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	CMK1	YFR014C	1341 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	KAR1	YNL188W	1302 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	HMS1	YOR032C	1305 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	KTR7	YIL085C	1554 nt		4.9	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SUR2	YDR297W	1050 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	GSY1	YFR015C	2127 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	TTI2	YJR136C	1266 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	ELF1	YKL160W	438 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	EBP2	YKL172W	1284 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YLR198C	YLR198C	360 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	CUS2	YNL286W	858 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	OPY2	YPR075C	1083 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RPL19A	YBR084C-A	570 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RER1	YCL001W	567 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	PRO2	YOR323C	1371 nt		4.89	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YER084W	YER084W	387 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SDT1	YGL224C	843 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YGR079W	YGR079W	1113 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YHB1	YGR234W	1200 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YIL165C	YIL165C	360 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YMR082C	YMR082C	357 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	APC1	YNL172W	5247 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	FBP26	YJL155C	1359 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	TPO2	YGR138C	1845 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	GCN20	YFR009W	2259 nt		4.88	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	IKS1	YJL057C	2004 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SBE2	YDR351W	2595 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SUP56	tL(CAA)A	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SUP53	tL(CAA)C	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)D	tL(CAA)D	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)G1	tL(CAA)G1	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SUP54	tL(CAA)G2	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)G3	tL(CAA)G3	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)K	tL(CAA)K	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)L	tL(CAA)L	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)M	tL(CAA)M	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tL(CAA)N	tL(CAA)N	82 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	FRA2	YGL220W	363 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	tS(AGA)D3	tS(AGA)D3	83 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	DCD1	YHR144C	939 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YLR462W	YLR462W	609 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	ERV41	YML067C	1059 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RRP14	YKL082C	1305 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	HES1	YOR237W	1305 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	KAR2	YJL034W	2049 nt		4.87	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	PMT4	YJR143C	2289 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	IME4	YGL192W	1803 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	MET12	YPL023C	1974 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	KIN28	YDL108W	921 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	IMP3	YHR148W	552 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RPS4B	YHR203C	786 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RPS4A	YJR145C	786 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	NIT3	YLR351C	876 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	CAB3	YKL088W	1716 nt		4.86	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	PRP43	YGL120C	2304 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	MRPL32	YCR003W	552 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RPL28	YGL103W	450 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	ARC1	YGL105W	1131 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	CPR6	YLR216C	1116 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YBL036C	YBL036C	774 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	AAH1	YNL141W	1044 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SNF8	YPL002C	702 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YPL114W	YPL114W	420 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YBR089W	YBR089W	600 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	MRPL37	YBR268W	318 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	IMD3	YLR432W	1572 nt		4.85	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RGP1	YDR137W	1992 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	FRS1	YLR060W	1788 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RSC6	YCR052W	1452 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	TMA17	YDL110C	453 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	RPC53	YDL150W	1269 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	BUD16	YEL029C	939 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YER145C-A	YER145C-A	438 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	YHR069C-A	YHR069C-A	363 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	MED7	YOL135C	669 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	BBC1	YJL020C	3474 nt		4.84	□□□□□ -1.63
SKP2	P42843	SAP4	YGL229C	2457 nt		4.84	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	TPS3	YMR261C	3165 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	OAF1	YAL051W	3144 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	APM2	YHL019C	1818 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	NMD3	YHR170W	1557 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	HFA1	YMR207C	6372 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	CPR4	YCR069W	957 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	YDL157C	YDL157C	357 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	AIM7	YDR063W	450 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	SPR28	YDR218C	1272 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	YER187W	YER187W	426 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	DDI2	YFL061W	678 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	DAM1	YGR113W	1032 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	CLC1	YGR167W	702 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	DCG1	YIR030C	735 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	CNB1	YKL190W	528 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	YML090W	YML090W	387 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	DDI3	YNL335W	678 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	PPG1	YNR032W	1107 nt		4.83	□□□□□ -1.64
SKP2	P42843	YND1	YER005W	1893 nt		4.83	□□□□□ -1.64

Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 18.1 ms