Protein–RNA interactions for Protein: P40225

THPO, Thrombopoietin, humanhuman

Predictions only

Length 353 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
THPOP40225 IRF3-207ENST00000593922 1494 ntTSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 SUGCT-209ENST00000628514 1591 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 AP005435.1-201ENST00000529293 1178 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 PPP1R14C-201ENST00000361131 2152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.52■■□□□ 1.52
THPOP40225 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 NREP-202ENST00000379671 2581 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 ST6GALNAC6-204ENST00000373144 2406 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 CREM-210ENST00000374721 2020 ntTSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 CD47-202ENST00000361309 1285 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 AC004911.1-201ENST00000416316 871 ntBASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.51■■□□□ 1.51
THPOP40225 RITA1-203ENST00000552495 1898 ntTSL 2 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 DAZAP1-205ENST00000587079 2086 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 HAS1-205ENST00000601714 2086 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 OSBP-201ENST00000263847 5083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.5■■□□□ 1.51
THPOP40225 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 GNAS-201ENST00000265620 1866 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 AL357033.1-201ENST00000370520 1933 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 DNAH9-209ENST00000579828 1986 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 PTH1R-202ENST00000418619 2070 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 GRPEL2-202ENST00000416916 1006 ntTSL 2 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 WT1-AS-205ENST00000494911 1320 ntTSL 4 BASIC24.49■■□□□ 1.51
THPOP40225 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 MIR31HG-201ENST00000304425 745 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 RUNDC3A-202ENST00000426726 2048 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 PYCR3-203ENST00000433751 1000 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 C17orf49-202ENST00000546495 996 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 ZNF444-211ENST00000592949 1906 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC24.48■■□□□ 1.51
THPOP40225 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THPOP40225 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THPOP40225 HIST2H2AC-201ENST00000331380 390 ntAPPRIS P1 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THPOP40225 TNFRSF18-202ENST00000379265 705 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.47■■□□□ 1.51
THPOP40225 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.47■■□□□ 1.51
THPOP40225 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 CAPN10-204ENST00000354082 1999 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 AIDA-202ENST00000355727 1072 ntTSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 BRD2-214ENST00000496118 735 ntTSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 ASRGL1-210ENST00000534571 639 ntTSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 HOXA4-204ENST00000610970 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.46■■□□□ 1.51
THPOP40225 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC24.45■■□□□ 1.51
THPOP40225 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.51
THPOP40225 TSEN34-201ENST00000302937 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 SNX5-201ENST00000377759 2270 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 ANKRD53-201ENST00000272421 2185 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 RASGRP2-203ENST00000377486 667 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 IL15RA-201ENST00000379971 588 ntTSL 3 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 DLX3-202ENST00000512495 834 ntTSL 2 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 TNFRSF11A-207ENST00000639222 855 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 CYP4V2-201ENST00000378802 2042 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 TXNRD2-201ENST00000334363 1893 ntTSL 1 (best) BASIC24.45■■□□□ 1.5
THPOP40225 EED-207ENST00000528180 1745 ntTSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 GLI4-201ENST00000340042 1341 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 PRKCZ-AS1-201ENST00000333854 1253 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 PPA1-202ENST00000373232 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 MOSPD3-202ENST00000379527 1016 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.44■■□□□ 1.5
THPOP40225 AC062017.1-203ENST00000413029 455 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 12.9 ms