Protein–RNA interactions for Protein: P37231

PPARG, Peroxisome proliferator-activated receptor gamma, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 505 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
PPARGP37231 RGS7-204ENST00000366565 2494 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.31■■□□□ 1.16
PPARGP37231 SLC35C1-202ENST00000442528 1756 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ANAPC13-201ENST00000354910 1209 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 TSPAN17-204ENST00000503045 1019 ntTSL 5 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ACSF2-207ENST00000504392 1881 ntTSL 2 BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 NIPSNAP1-201ENST00000216121 2237 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 MAPK12-211ENST00000622558 1779 ntTSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.3■■□□□ 1.16
PPARGP37231 H19-210ENST00000439725 1929 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 UBALD1-206ENST00000590965 1462 ntTSL 2 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 EFCC1-201ENST00000436022 2691 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 NKX2-4-201ENST00000351817 2238 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ACTL10-201ENST00000330271 2028 ntAPPRIS P1 BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 HES5-201ENST00000378453 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.29■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC233723.2-201ENST00000623798 2106 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 ZDHHC20-203ENST00000400590 1869 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 FP325331.1-202ENST00000623531 1380 ntBASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 IMPDH1-210ENST00000480861 1765 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 CRYAA-201ENST00000291554 1139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 SDHAP1-204ENST00000427415 559 ntTSL 4 BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 POLDIP2-201ENST00000540200 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 C20orf27-202ENST00000379772 1886 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.28■■□□□ 1.16
PPARGP37231 DUSP8P3-201ENST00000399571 1760 ntBASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 MYBL2-201ENST00000217026 2639 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 DRAP1-201ENST00000312515 989 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 RAB32-201ENST00000367495 1217 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AC103702.2-201ENST00000433510 1270 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AK3-203ENST00000447596 705 ntTSL 2 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AL117209.1-201ENST00000560931 828 ntTSL 3 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 MRGPRF-AS1-203ENST00000569432 542 ntTSL 4 BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 AMZ2-219ENST00000612294 1498 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.16
PPARGP37231 HOMER3-204ENST00000539827 1979 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.27■■□□□ 1.15
PPARGP37231 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SRI-201ENST00000265729 2010 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SDK1-201ENST00000389531 7606 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 CABLES1-201ENST00000256925 5002 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 TANGO2-201ENST00000327374 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 C19orf68-201ENST00000328759 2277 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PRELID1-203ENST00000503216 1171 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 GRAMD4P7-201ENST00000578182 1232 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 AL356740.2-201ENST00000601559 647 ntBASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 DENND1B-204ENST00000367396 2177 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC22.26■■□□□ 1.15
PPARGP37231 LSR-202ENST00000354900 2105 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PCSK6-215ENST00000611967 3336 ntTSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGP37231 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PARD3-210ENST00000374794 5669 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGP37231 TCP1-202ENST00000392168 1878 ntTSL 5 BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGP37231 CDIPT-201ENST00000219789 2353 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.25■■□□□ 1.15
PPARGP37231 XBP1-201ENST00000216037 1850 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 COMT-206ENST00000407537 1457 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SLC10A3-201ENST00000263512 2161 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 GPX4-213ENST00000622390 1002 ntTSL 5 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 TUBBP5-204ENST00000635438 565 ntTSL 4 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 DTX4-201ENST00000227451 5642 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 ARL6IP4-201ENST00000315580 1644 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.24■■□□□ 1.15
PPARGP37231 CNN3-201ENST00000370206 2165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 EEF1D-203ENST00000419152 1452 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 FAM129C-211ENST00000600871 1822 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PEMT-202ENST00000395781 1050 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 CFD-202ENST00000592860 809 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SLC16A10-206ENST00000612036 1231 ntTSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 EID2B-201ENST00000326282 1865 ntAPPRIS P1 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SNRNP70-201ENST00000221448 1603 ntTSL 2 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.23■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 AC009102.2-201ENST00000606772 1639 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 ARPC4-208ENST00000498623 942 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 TMEM218-209ENST00000529583 848 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PRSS21-201ENST00000005995 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PPAN-201ENST00000253107 1657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 LINC01529-204ENST00000636474 1715 ntBASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 CCDC157-202ENST00000399824 1759 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.22■■□□□ 1.15
PPARGP37231 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 IER5L-201ENST00000372491 2711 ntAPPRIS P1 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 AL117332.1-201ENST00000622628 974 ntBASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 HAUS7-211ENST00000626181 414 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 NAE1-202ENST00000359087 1825 ntTSL 2 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 OBSL1-214ENST00000603926 5520 ntTSL 5 BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
PPARGP37231 PDLIM2-203ENST00000339162 2226 ntTSL 1 (best) BASIC22.21■■□□□ 1.15
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 20.6 ms