Protein–RNA interactions for Protein: P35212

GJA4, Gap junction alpha-4 protein, humanhuman

Predictions only

Length 333 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
GJA4P35212 FAM110A-206ENST00000541082 1614 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 RCAN1-201ENST00000313806 2490 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AC090192.1-201ENST00000517740 490 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 MIF4GD-211ENST00000580571 952 ntTSL 2 BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AL137784.2-201ENST00000607332 1000 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AC092437.1-201ENST00000624794 1048 ntBASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SPIRE2-205ENST00000563972 1823 ntTSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 CAPG-201ENST00000263867 1442 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 C1QL2-201ENST00000272520 2043 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.79■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PTX3-201ENST00000295927 1940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 EXOC3-209ENST00000512944 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 FBXO45-201ENST00000311630 5899 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AC019068.1-201ENST00000415226 552 ntTSL 4 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 PON2-202ENST00000433091 1726 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 KDELR1-203ENST00000597017 1594 ntTSL 2 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 ACAA1-219ENST00000625927 1760 ntTSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 TTC34-202ENST00000637179 1775 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 MRPL37-202ENST00000360840 1483 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SETD9-211ENST00000628593 1306 ntTSL 1 (best) BASIC22.78■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SPATA22-214ENST00000575375 1374 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 NAGLU-201ENST00000225927 2544 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 GADD45G-202ENST00000375769 977 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SLC26A1-203ENST00000398520 1111 ntTSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AC080013.1-202ENST00000465477 674 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 SUZ12P1-202ENST00000578070 929 ntTSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 CBARP-202ENST00000382477 2453 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 NDUFAF1-201ENST00000260361 1461 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 AP1S1-201ENST00000337619 1306 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.24
GJA4P35212 APBA3-201ENST00000316757 2075 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ZNF205-202ENST00000382192 2062 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.77■■□□□ 1.23
GJA4P35212 PPP1R26-201ENST00000356818 4932 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 PLBD2-202ENST00000545182 2321 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 HMGA2-205ENST00000425208 1444 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 DCAF8-211ENST00000475733 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 SLC35A2-205ENST00000376529 865 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ZNF302-209ENST00000507959 854 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AC104986.2-201ENST00000521696 380 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 TSEN15-207ENST00000533373 618 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 KRT18P14-201ENST00000534205 1250 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 PDCD5-204ENST00000586035 601 ntTSL 3 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 PGF-203ENST00000553716 1699 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 KLC1-203ENST00000347839 2271 ntTSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ZNF205-201ENST00000219091 1947 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.76■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 TMED2-201ENST00000262225 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 C5orf38-201ENST00000334000 890 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 PRKCQ-AS1-202ENST00000445427 1133 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 TERF1P2-201ENST00000583350 1212 ntBASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 CAPNS1-207ENST00000589146 578 ntTSL 3 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 MRM1-203ENST00000612760 1284 ntTSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 RARA-204ENST00000394089 2024 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 UBALD1-208ENST00000591401 1305 ntTSL 5 BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 MTX2-201ENST00000249442 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.75■■□□□ 1.23
GJA4P35212 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA4P35212 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ATE1-AS1-201ENST00000437593 951 ntTSL 2 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AC024267.6-201ENST00000580603 583 ntTSL 3 BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AC020928.2-201ENST00000588717 2197 ntBASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.74■■□□□ 1.23
GJA4P35212 MAPK8IP1P2-201ENST00000580257 1472 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 BBC3-202ENST00000341983 1538 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ZNF219-201ENST00000360947 3071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 NT5C3AP1-201ENST00000394500 1012 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ITGA9-AS1-210ENST00000457661 738 ntTSL 4 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 NTF6G-201ENST00000591094 616 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AP2S1-203ENST00000593442 636 ntTSL 2 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AC105233.4-201ENST00000642045 216 ntBASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AVPR2-203ENST00000370049 1307 ntTSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 MPST-204ENST00000404393 1329 ntTSL 5 BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 SLC15A3-201ENST00000227880 2115 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 MSX2-201ENST00000239243 2241 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.73■■□□□ 1.23
GJA4P35212 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 POLD2-207ENST00000452185 1659 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 YIF1B-202ENST00000337679 1257 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 MELTF-AS1-202ENST00000415244 951 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 GXYLT1P2-201ENST00000433312 1230 ntBASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 TMEM218-207ENST00000528724 1117 ntTSL 5 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 TMEM218-214ENST00000532156 954 ntTSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 TBR1-202ENST00000410035 1454 ntTSL 2 BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.72■■□□□ 1.23
GJA4P35212 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 SPTSSA-201ENST00000298130 2777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 C1QL1-201ENST00000253407 1295 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 ELANE-202ENST00000590230 1028 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 RIMKLB-205ENST00000535829 2236 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 DEDD-212ENST00000545495 2329 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 CLN3-207ENST00000395653 1430 ntTSL 5 BASIC22.71■■□□□ 1.23
GJA4P35212 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.7■■□□□ 1.23
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 56.6 ms