Protein–RNA interactions for Protein: P31277

HOXD11, Homeobox protein Hox-D11, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 338 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXD11P31277 DEFT1P-201ENST00000453425 496 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 YKT6-207ENST00000496112 1270 ntTSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 LINC01585-201ENST00000500496 1295 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC069234.2-201ENST00000541383 575 ntTSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 RN7SL48P-201ENST00000579283 293 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 LGI4-206ENST00000591633 1113 ntTSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 BHLHA15-202ENST00000609256 796 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 MIR6084-201ENST00000622012 110 ntBASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 FNDC5-207ENST00000640867 639 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 ZNF513-201ENST00000323703 2139 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 OTUD5-201ENST00000156084 2740 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 UCN-201ENST00000296099 795 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 MT1M-201ENST00000379818 829 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 HES6-206ENST00000409574 738 ntTSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 FAM210CP-201ENST00000445714 574 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 GTPBP8-204ENST00000467752 686 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AP001981.1-201ENST00000531132 738 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC027307.1-201ENST00000590252 457 ntTSL 5 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 SAP25-203ENST00000614631 987 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC22.99■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 TPRA1-209ENST00000489960 1903 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 CUL4A-202ENST00000375440 2364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 WDR86-203ENST00000469830 1691 ntTSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 TPSG1-201ENST00000234798 1108 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 GUK1-201ENST00000312726 1084 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC137761.2-201ENST00000561729 223 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC145350.3-201ENST00000569033 163 ntBASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 GALK1-201ENST00000225614 1445 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 HNRNPL-201ENST00000221419 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.98■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 BIN1-204ENST00000348750 2074 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 CCKBR-206ENST00000532715 1734 ntTSL 3 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 GAL3ST1-205ENST00000406361 1819 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 ARF3-202ENST00000447318 1089 ntTSL 2 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AL451069.1-201ENST00000455414 634 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AP000944.1-201ENST00000533886 564 ntTSL 4 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC012414.1-201ENST00000556676 535 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 BID-214ENST00000617586 542 ntTSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC106795.5-201ENST00000623288 454 ntBASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 TALDO1-201ENST00000319006 1346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 CUEDC1-202ENST00000407144 2190 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 WTAP-201ENST00000337387 1622 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 NPHS2-202ENST00000367616 1670 ntTSL 1 (best) BASIC22.97■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 EMC10-202ENST00000376918 2014 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 KRT18P29-201ENST00000397031 1267 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 MTCO2P3-201ENST00000442543 421 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC087289.4-201ENST00000587348 230 ntTSL 3 BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC092964.1-201ENST00000623304 1399 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 UBL7-202ENST00000395081 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 GSR-206ENST00000546342 1482 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 LTB4R-202ENST00000396782 1627 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AL135925.1-201ENST00000605920 1701 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 AC100797.4-201ENST00000631653 1827 ntBASIC22.96■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.27
HOXD11P31277 GZMM-201ENST00000264553 940 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 KCNQ2-201ENST00000344425 1426 ntTSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TPRA1-202ENST00000355552 1933 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 PDK1-202ENST00000392571 1515 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CT47A12-201ENST00000419982 1165 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC104457.2-201ENST00000446055 467 ntTSL 2 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 RPS2P52-201ENST00000469610 820 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 LINC01024-205ENST00000521563 939 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 C12orf75-205ENST00000549893 719 ntTSL 3 BASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC012181.2-201ENST00000570210 699 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 BNIP3P35-201ENST00000604530 490 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 Metazoa_SRP.33-201ENST00000613468 285 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 LINC02228-203ENST00000641970 1355 ntBASIC22.95■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 RCC1L-202ENST00000614461 2419 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MFSD12-202ENST00000389395 2039 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC073508.3-201ENST00000619697 1419 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 EPO-201ENST00000252723 1330 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC005703.6-201ENST00000623265 1329 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 LGALS7-201ENST00000378626 466 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AL161908.1-203ENST00000425370 506 ntTSL 2 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AL390879.2-204ENST00000438602 582 ntTSL 3 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MTND1P26-201ENST00000440488 538 ntBASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 SEPT4-215ENST00000580809 952 ntTSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC004528.2-201ENST00000610701 440 ntTSL 5 BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 REXO4-202ENST00000371942 2360 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.94■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 HMX2-201ENST00000339992 1628 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 CD1B-201ENST00000368168 1395 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 GPALPP1-203ENST00000379151 1393 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 ALKBH7-201ENST00000245812 1332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 PRORSD1P-201ENST00000295112 541 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 C20orf144-201ENST00000375222 571 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 MIR663A-201ENST00000385250 93 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 RNF208-201ENST00000391553 1077 ntAPPRIS P1 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 RNF208-202ENST00000392827 1135 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 HSCB-202ENST00000398941 955 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC006041.1-201ENST00000425322 328 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 POU5F1P3-201ENST00000428824 1078 ntBASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC099677.4-201ENST00000446786 380 ntTSL 3 BASIC22.93■■□□□ 1.26
HOXD11P31277 AC011131.1-201ENST00000521224 252 ntTSL 2 BASIC22.93■■□□□ 1.26
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 45.7 ms