Protein–RNA interactions for Protein: P31260

HOXA10, Homeobox protein Hox-A10, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 410 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HOXA10P31260 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.62■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 NFKBIB-201ENST00000313582 1159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 CTBP1-201ENST00000290921 2297 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC27.61■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 CACNG7-203ENST00000391767 2688 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 ARPC5L-202ENST00000353214 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.6■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 C4orf19-202ENST00000381980 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 FLJ37453-201ENST00000317122 2473 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AC099681.3-201ENST00000421500 939 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 TMEM230-210ENST00000612323 1231 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC27.59■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 NUDT14-202ENST00000392568 845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AC073343.2-201ENST00000413182 548 ntTSL 4 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 TPRG1LP1-201ENST00000598702 760 ntBASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC27.58■■■□□ 2.01
HOXA10P31260 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 RAP2CP1-201ENST00000605103 478 ntBASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 RNF114-202ENST00000622920 1284 ntTSL 5 BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.57■■■□□ 2
HOXA10P31260 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA10P31260 AL137779.2-201ENST00000554859 448 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA10P31260 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA10P31260 AC011511.3-201ENST00000587088 355 ntTSL 2 BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA10P31260 SLC25A39-201ENST00000225308 1607 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.56■■■□□ 2
HOXA10P31260 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 NXT1-201ENST00000254998 1123 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 TMEM191B-201ENST00000612978 1220 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 MPST-205ENST00000404802 1453 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC27.55■■■□□ 2
HOXA10P31260 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC27.54■■■□□ 2
HOXA10P31260 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 POLR3GL-201ENST00000369313 818 ntTSL 2 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 HLA-L-209ENST00000420110 1011 ntBASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 ABHD14A-202ENST00000458031 1113 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 IFNGR2-202ENST00000381995 1742 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC27.53■■■□□ 2
HOXA10P31260 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 AP001363.2-201ENST00000538101 391 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 RNASEH2B-206ENST00000611510 1257 ntTSL 5 BASIC27.52■■■□□ 2
HOXA10P31260 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 URAD-201ENST00000332715 931 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 VGLL4-208ENST00000424529 1025 ntTSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 AC092468.1-201ENST00000491321 562 ntTSL 4 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 ZNF696-205ENST00000521537 705 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 AC012414.4-201ENST00000560839 1074 ntTSL 5 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 AC060814.5-201ENST00000630916 1074 ntTSL 2 BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
HOXA10P31260 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC27.51■■□□□ 1.99
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 16.8 ms