Protein–RNA interactions for Protein: P24863

CCNC, Cyclin-C, humanhuman

Predictions only

Length 283 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CCNCP24863 ARHGAP27-207ENST00000528273 2319 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 GATA3-AS1-201ENST00000355358 2214 ntTSL 2 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SMARCA5-AS1-201ENST00000500800 945 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC131281.2-201ENST00000520478 145 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 TMC6-218ENST00000591436 1155 ntTSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC099791.2-201ENST00000605725 427 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AL499627.2-201ENST00000606283 725 ntBASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ADSS-201ENST00000366535 2780 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 BCL11B-203ENST00000443726 2599 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 OLIG1-201ENST00000382348 2277 ntAPPRIS P1 BASIC22.68■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CPOX-201ENST00000264193 2825 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SLC52A2-211ENST00000532887 2147 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 FXYD3-201ENST00000344013 1404 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SUMF1-202ENST00000383843 1447 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 GLT8D2-205ENST00000548660 1835 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 HOXA11-AS1_1.1-201ENST00000613939 98 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CLDN5-203ENST00000413119 1760 ntTSL 2 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LAYN-209ENST00000533265 1703 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC007326.4-201ENST00000638240 1669 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 HSF1-201ENST00000400780 2105 ntTSL 5 BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 RBM42-203ENST00000588161 1609 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AKT1-201ENST00000349310 2866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 GTSE1-AS1-202ENST00000623117 1518 ntBASIC22.67■■□□□ 1.22
CCNCP24863 VGLL2-201ENST00000326274 2212 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ADAM22-209ENST00000439864 2576 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CBWD5-207ENST00000382405 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SYT6-209ENST00000610222 1707 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CTU2-201ENST00000312060 1672 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 IL15RA-209ENST00000397255 759 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ARFIP2-205ENST00000525235 852 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 IL15RA-216ENST00000530685 660 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LRRK1-208ENST00000532029 1241 ntTSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CCER2-201ENST00000571838 1057 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC131212.1-201ENST00000613771 668 ntBASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LY6H-205ENST00000615409 980 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 CCDC154-201ENST00000389176 2212 ntAPPRIS P5 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 FAM47E-201ENST00000424749 1484 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.66■■□□□ 1.22
CCNCP24863 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 MAL2-204ENST00000614891 2818 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LEFTY1-201ENST00000272134 1626 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 SLC2A8-203ENST00000373371 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 C3orf80-201ENST00000326474 2718 ntAPPRIS P1 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 LRIG1-202ENST00000383703 5283 ntTSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC073934.1-201ENST00000490314 495 ntTSL 4 BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 NUDT18-201ENST00000611621 1497 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 AC133561.1-201ENST00000568600 2415 ntBASIC22.65■■□□□ 1.22
CCNCP24863 PSPH-201ENST00000275605 2131 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNCP24863 PIKFYVE-203ENST00000392202 2039 ntTSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNCP24863 ZNF76-203ENST00000373953 2716 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.22
CCNCP24863 H1FX-201ENST00000333762 1507 ntAPPRIS P1 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 UBA5-208ENST00000473651 1513 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 TMEM165-204ENST00000506198 828 ntTSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 AL445237.1-202ENST00000604581 425 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SHISA9-205ENST00000639941 1135 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 RBM4B-203ENST00000525754 2339 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 THOC6-202ENST00000326266 1419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.64■■□□□ 1.21
CCNCP24863 C1orf229-201ENST00000623686 2258 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 CCDC7-201ENST00000277657 1899 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 AC006455.2-201ENST00000429931 906 ntBASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 DONSON-202ENST00000303113 2028 ntTSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 NRG2-201ENST00000289409 2535 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 ECE2-202ENST00000357474 2667 ntTSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.63■■□□□ 1.21
CCNCP24863 ST8SIA6-201ENST00000377602 2276 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 MAP2K5-204ENST00000395476 1689 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 B3GALT4-204ENST00000451237 1694 ntAPPRIS P1 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 HAGHL-212ENST00000564537 1667 ntTSL 2 BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 CLTB-201ENST00000310418 1215 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 CLTB-202ENST00000345807 1161 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 ACYP2-202ENST00000394666 993 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 MAST4-206ENST00000406374 1066 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 AL122058.1-201ENST00000412321 1166 ntTSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SH3YL1-201ENST00000356150 1763 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 BFSP1-202ENST00000377873 2207 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 PTGES2-202ENST00000338961 2331 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.62■■□□□ 1.21
CCNCP24863 GALC-202ENST00000393568 2054 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 NDUFV2-201ENST00000318388 930 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 CFP-202ENST00000377005 1435 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SENCR-201ENST00000526269 1298 ntTSL 1 (best) BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 NR2F1-AS1-210ENST00000606739 1431 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
CCNCP24863 SCUBE1-208ENST00000615096 1119 ntTSL 2 BASIC22.61■■□□□ 1.21
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 24 ms