Protein–RNA interactions for Protein: P19113

HDC, Histidine decarboxylase, humanhuman

Predictions only

Length 662 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
HDCP19113 POLD2-218ENST00000610533 1619 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 AL121749.1-201ENST00000635993 1768 ntTSL 5 BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC23.22■■□□□ 1.31
HDCP19113 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 HEXDC-202ENST00000337014 2285 ntTSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 RNPEP-202ENST00000367286 2282 ntTSL 5 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 JTB-203ENST00000368589 1216 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 AC097381.1-201ENST00000429019 1296 ntBASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 AC011446.1-201ENST00000591825 458 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 HOXB7-201ENST00000239165 1371 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 RNASEH2B-201ENST00000336617 1629 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 LRRC34-206ENST00000522526 1899 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 P4HA3-201ENST00000331597 2274 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.21■■□□□ 1.31
HDCP19113 KCNIP1-203ENST00000390656 2249 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 ZNF767P-202ENST00000472212 2100 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 PON2-217ENST00000633192 1876 ntTSL 1 (best) BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 HACD3-205ENST00000562901 1797 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 SPRED3-204ENST00000587013 1539 ntTSL 5 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 TSPY26P-201ENST00000476365 1326 ntBASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 ORAI3-202ENST00000562699 628 ntTSL 2 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 FAM222B-208ENST00000581381 556 ntTSL 4 BASIC23.2■■□□□ 1.3
HDCP19113 LRRC24-201ENST00000529415 1758 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 IRF3-201ENST00000309877 1691 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 FAM53B-201ENST00000280780 1568 ntTSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 SDC3-202ENST00000339394 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 HSPBP1-206ENST00000587922 1449 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 PYCARD-201ENST00000247470 990 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 LRRC73-201ENST00000372441 2121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 AICDA-202ENST00000537228 667 ntTSL 5 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 SLC39A3-203ENST00000545664 1219 ntTSL 2 BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 AIPL1-206ENST00000571740 1202 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.19■■□□□ 1.3
HDCP19113 CAPN10-207ENST00000391984 2644 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 SIN3B-209ENST00000596802 2556 ntTSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 AURKAIP1-204ENST00000378853 875 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 ZEB1-AS1-201ENST00000423714 456 ntTSL 3 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 UBE2E2-203ENST00000425792 1248 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 MLF2-206ENST00000539187 1110 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 HERC2P4-206ENST00000568097 1062 ntTSL 5 BASIC23.18■■□□□ 1.3
HDCP19113 CPLX1-201ENST00000304062 2181 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDCP19113 ABCB10P4-201ENST00000566803 2184 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDCP19113 TSKS-202ENST00000358830 1367 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC010525.1-201ENST00000585559 441 ntBASIC23.17■■□□□ 1.3
HDCP19113 NKIRAS2-204ENST00000393880 1644 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDCP19113 RPIA-201ENST00000283646 1848 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.17■■□□□ 1.3
HDCP19113 KCNN1-204ENST00000615435 1691 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 MESP2-201ENST00000341735 1552 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 RPL8-201ENST00000262584 1041 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 CEP104-201ENST00000378223 1121 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 MYD88-205ENST00000424893 1279 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 ATP6V0B-204ENST00000471859 865 ntTSL 5 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 KLC3-202ENST00000470402 1820 ntTSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC011498.4-201ENST00000586020 1803 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 KREMEN2-204ENST00000572045 2339 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 ATAD3A-203ENST00000378756 2492 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.16■■□□□ 1.3
HDCP19113 STARD3NL-202ENST00000396013 1365 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 ZDHHC14-204ENST00000414563 3134 ntTSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 PHF10-202ENST00000366780 1589 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 LINC00454-202ENST00000430978 1327 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 MMD-201ENST00000262065 2735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 P2RX4-211ENST00000543171 1777 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 KLRG2-202ENST00000393039 1148 ntTSL 5 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 CCDC115-202ENST00000409127 1247 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 OR2I1P-207ENST00000453522 948 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC116614.1-201ENST00000456949 539 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC010203.1-202ENST00000550096 695 ntTSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC006538.2-201ENST00000586572 543 ntAPPRIS P1 TSL 4 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 UQCR11-202ENST00000589880 504 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC087623.3-201ENST00000607047 1098 ntBASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 AC010999.2-201ENST00000621974 596 ntTSL 2 BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 RAX2-202ENST00000555978 2145 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 BMP2K-204ENST00000502871 3195 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.15■■□□□ 1.3
HDCP19113 ALKAL2-204ENST00000403610 1389 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDCP19113 MAGI2-208ENST00000522391 4878 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDCP19113 C11orf96-201ENST00000339446 1308 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDCP19113 ARRDC2-202ENST00000379656 2528 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.3
HDCP19113 AK1-201ENST00000223836 736 ntTSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 MED14OS-201ENST00000456333 900 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 IGHV3-19-201ENST00000521488 291 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 PLD4-205ENST00000553861 667 ntTSL 2 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 AES-207ENST00000586839 942 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 HOMER3-206ENST00000594439 982 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 AC092666.2-201ENST00000613287 246 ntBASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 MAP3K5-201ENST00000359015 5197 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 GFRA3-202ENST00000378362 1837 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 NABP2-202ENST00000341463 1411 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 KRTAP5-7-201ENST00000398536 1408 ntAPPRIS P1 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 SAMD4B-208ENST00000598913 2877 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 AL591684.2-201ENST00000605970 1594 ntTSL 5 BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 LSM8-203ENST00000422760 1920 ntTSL 1 (best) BASIC23.14■■□□□ 1.29
HDCP19113 LTK-203ENST00000453182 2412 ntTSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 SMIM19-203ENST00000417410 1466 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 EZH2-208ENST00000483967 2466 ntAPPRIS ALT1 TSL 2 BASIC23.13■■□□□ 1.29
HDCP19113 AP003419.1-201ENST00000535922 470 ntTSL 3 BASIC23.13■■□□□ 1.29
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 48.6 ms