Protein–RNA interactions for Protein: P18887

XRCC1, DNA repair protein XRCC1, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 633 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
XRCC1P18887 DTNB-206ENST00000404103 2384 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.11■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 C6orf201-202ENST00000380175 1834 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 B3GNT6-202ENST00000622824 2503 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 DNPH1-201ENST00000230431 657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 B3GALNT2-202ENST00000366600 2015 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 MIR638-201ENST00000385237 100 ntBASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 PRICKLE4-201ENST00000394259 939 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 CALM1-203ENST00000544280 1064 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 CCDC189-211ENST00000545825 1046 ntTSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 PPP1R14A-204ENST00000591291 433 ntTSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 KRTAP5-4-202ENST00000616115 660 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 TMEM121-202ENST00000431372 1519 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 OAS3-205ENST00000548514 1392 ntTSL 2 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 C1QTNF1-207ENST00000580454 1396 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 EGR4-202ENST00000545030 2372 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AKT1S1-204ENST00000391832 1911 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.1■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 PRKAR1B-211ENST00000537384 2533 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 POLR2F-211ENST00000488684 564 ntTSL 2 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 C17orf74-202ENST00000574034 1287 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 GRAMD1B-217ENST00000640939 1212 ntTSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 NIPA2-202ENST00000359727 1531 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 B3GNT4-201ENST00000324189 1642 ntTSL 1 (best) BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 EEF1D-201ENST00000317198 1458 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC22.09■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 AC019069.1-201ENST00000610008 1333 ntBASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 UBALD1-201ENST00000283474 1413 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 KISS1R-201ENST00000234371 1625 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 KCTD15-207ENST00000589786 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC22.08■■□□□ 1.13
XRCC1P18887 LYPLA1-201ENST00000316963 2585 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 KAT5-201ENST00000341318 2296 ntTSL 1 (best) BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 AF117829.1-207ENST00000504145 1572 ntTSL 3 BASIC22.08■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CCDC166-201ENST00000542437 1320 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PSKH1-202ENST00000570631 1509 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 GRIN2D-201ENST00000263269 5093 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 DUX4L19-201ENST00000557448 1267 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 AC133561.4-201ENST00000566112 224 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ARHGDIA-217ENST00000584461 886 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 AC092171.4-201ENST00000609130 632 ntBASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SLC35B2-201ENST00000393810 1898 ntTSL 2 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PFKFB3-201ENST00000317350 1999 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC22.07■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CDC16-206ENST00000375310 2156 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PRODH-203ENST00000357068 2462 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 C17orf82-201ENST00000623772 1530 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 C21orf2-203ENST00000397956 1634 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ADORA2B-201ENST00000304222 1735 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 MYBL1-201ENST00000517885 1714 ntTSL 5 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SMARCD2-201ENST00000225742 1800 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 RASSF10-201ENST00000529419 2530 ntAPPRIS P1 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 UNC93B3-201ENST00000308076 687 ntBASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 DPP10-AS1-201ENST00000432658 730 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SMARCB1-201ENST00000263121 1690 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CRTC2-203ENST00000368633 2644 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 HSD11B1L-203ENST00000342970 1620 ntTSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 STMN4-204ENST00000519997 1623 ntTSL 2 BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.06■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 FKBP8-209ENST00000597960 1781 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 NANOS2-201ENST00000341294 1657 ntAPPRIS P1 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SPANXA2-OT1-201ENST00000622372 1686 ntTSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PLPP1-202ENST00000307259 1597 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SLC35A3-216ENST00000639221 1032 ntTSL 5 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 WRNIP1-204ENST00000380773 2670 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 DCAF4-206ENST00000509153 1521 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 NIPSNAP2-201ENST00000322090 1999 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.05■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ZNF668-205ENST00000426488 2282 ntTSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 LYPD2-201ENST00000359228 594 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 TNFRSF6B-201ENST00000369996 1124 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ZNF32-202ENST00000395797 1201 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 NRL-205ENST00000560550 788 ntTSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 AC106739.1-201ENST00000617035 715 ntBASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SNUPN-207ENST00000567134 1641 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 TMEM102-202ENST00000396568 1962 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CIDEB-201ENST00000258807 2294 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.04■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 KCNIP2-206ENST00000356640 1989 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ARL2BP-201ENST00000219204 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CDX1-201ENST00000231656 1758 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 VAMP2-204ENST00000488857 874 ntAPPRIS ALT1 TSL 3 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 TYROBP-203ENST00000544690 522 ntTSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CBWD2-203ENST00000416503 1665 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 UBAP1L-203ENST00000559089 1694 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 TBX1-202ENST00000332710 2084 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ZNF837-202ENST00000597582 1969 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 C14orf80-206ENST00000392527 1476 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC22.03■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 WRNIP1-203ENST00000380771 2595 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ECHDC1-203ENST00000368291 1354 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PDLIM2-202ENST00000308354 2236 ntTSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 CARD19-201ENST00000375464 855 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 PBX2P1-201ENST00000493219 1291 ntBASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 SF1-220ENST00000626028 704 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 ANXA8-204ENST00000583911 1874 ntTSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 NEIL1-206ENST00000564784 2019 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC22.02■■□□□ 1.12
XRCC1P18887 NKX6-2-201ENST00000368592 2673 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.02■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 REEP5-202ENST00000379638 3326 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
XRCC1P18887 SCAMP3-202ENST00000355379 1537 ntTSL 1 (best) BASIC22.01■■□□□ 1.11
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 25.6 ms