Protein–RNA interactions for Protein: P17987

TCP1, T-complex protein 1 subunit alpha, humanhuman

Known RBP Predictions only

Length 556 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TCP1P17987 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC064853.3-201ENST00000641801 1658 ntAPPRIS P1 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 IKBKG-211ENST00000615874 1460 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 IKBKG-215ENST00000619941 1463 ntTSL 5 BASIC23.43■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 ADORA2A-AS1-203ENST00000427813 2027 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 FAM19A5-202ENST00000358295 2638 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AL117348.2-201ENST00000432920 1625 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 NOX4-204ENST00000393282 560 ntTSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 UBALD1-203ENST00000587649 707 ntTSL 3 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC019171.1-201ENST00000601251 1056 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 GNAS-AS1_1.1-201ENST00000621898 103 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 FBXW4P1-201ENST00000426721 2239 ntBASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC009126.1-201ENST00000501338 2245 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 ILDR2-204ENST00000525740 2242 ntTSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PTOV1-220ENST00000601675 1587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 MEF2A-207ENST00000558812 2186 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 SPG21-202ENST00000416889 1533 ntTSL 2 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 LTK-201ENST00000263800 3046 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 CPNE2-201ENST00000290776 2645 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.42■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TSNARE1-208ENST00000524325 1963 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 ZNF584-203ENST00000593920 2187 ntTSL 2 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 EPHA10-211ENST00000540011 720 ntTSL 5 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 FAM222B-205ENST00000577682 549 ntTSL 4 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC005551.1-201ENST00000641816 493 ntAPPRIS P1 BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TRIM28-201ENST00000253024 2960 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 MANEAL-203ENST00000397631 2327 ntTSL 1 (best) BASIC23.41■■□□□ 1.34
TCP1P17987 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TMEM25-205ENST00000411589 2442 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TMEM171-202ENST00000454765 1535 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 TMEM44-211ENST00000473092 1508 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PMPCA-201ENST00000371717 2174 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 REPS2-202ENST00000357277 7953 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC009531.1-201ENST00000442323 580 ntTSL 4 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AC092807.3-205ENST00000467666 531 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 AP000911.3-201ENST00000526377 1130 ntTSL 3 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 MXRA8-201ENST00000309212 2273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 PUF60-203ENST00000453551 1842 ntTSL 1 (best) BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 SH3D19-211ENST00000604030 5228 ntTSL 5 BASIC23.4■■□□□ 1.34
TCP1P17987 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ILDR2-206ENST00000528703 2446 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCP1P17987 FAR2P4-203ENST00000560285 1739 ntTSL 2 BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCP1P17987 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.39■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ZSWIM7-201ENST00000399277 2008 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 CERS1-205ENST00000623927 2558 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 PFDN2-201ENST00000368010 677 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 AL354928.1-201ENST00000438380 617 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 AC004448.1-201ENST00000458332 883 ntBASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ICAM5-201ENST00000221980 3000 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 RAD51-210ENST00000557850 1397 ntTSL 2 BASIC23.38■■□□□ 1.33
TCP1P17987 APLP1-203ENST00000586861 2052 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP1P17987 LCK-214ENST00000619559 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP1P17987 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP1P17987 USF2-207ENST00000595068 1612 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP1P17987 DPF1-217ENST00000614244 2356 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP1P17987 CACNB1-203ENST00000394310 1753 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ZNF669-201ENST00000343381 1951 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 AF131216.4-201ENST00000638924 1588 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 RSPO4-202ENST00000400634 722 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 SMKR1-201ENST00000462322 1035 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 LRCH4-209ENST00000497245 2014 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
TCP1P17987 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ABHD17B-202ENST00000377041 1312 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ITPKC-201ENST00000263370 3385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 RPS2-201ENST00000343262 985 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 C17orf49-201ENST00000439424 850 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ZIM2-201ENST00000593711 2083 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ANAPC4-201ENST00000315368 2685 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ASCC1-204ENST00000394915 1510 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 ABHD17AP3-201ENST00000503096 1137 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 PHF11-202ENST00000378319 1359 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 MPPED1-203ENST00000443721 2507 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
TCP1P17987 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 23 ms