Protein–RNA interactions for Protein: P16109

SELP, P-selectin, humanhuman

Predictions only

Length 830 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SELPP16109 PLPPR3-204ENST00000520876 2328 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 ASMT-202ENST00000381233 989 ntTSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 ZFAS1-206ENST00000450535 1075 ntTSL 3 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 ANAPC11-219ENST00000583839 499 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 EIF3J-202ENST00000424492 1550 ntTSL 4 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 ZIC2-201ENST00000376335 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 STX4-202ENST00000394998 1498 ntTSL 2 BASIC24.44■■□□□ 1.5
SELPP16109 FAM83F-202ENST00000473717 1917 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 TCTEX1D4-201ENST00000339355 763 ntAPPRIS P1 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 AL021707.1-201ENST00000416406 500 ntTSL 3 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 FGF12-AS2-201ENST00000443165 580 ntTSL 4 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 AC145207.2-202ENST00000576554 565 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 HHEX-201ENST00000282728 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 EI24-213ENST00000618552 1747 ntTSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 AC012645.1-201ENST00000515455 1650 ntTSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 AJAP1-201ENST00000378190 2383 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 B3GAT3-201ENST00000265471 1641 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.43■■□□□ 1.5
SELPP16109 TLX1-203ENST00000467928 1838 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELPP16109 SIRT7-201ENST00000328666 1743 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELPP16109 LRRC75A-AS1-202ENST00000470491 1057 ntTSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELPP16109 GTPBP3-203ENST00000361619 1894 ntTSL 2 BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELPP16109 BBC3-203ENST00000439096 1838 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.42■■□□□ 1.5
SELPP16109 USF3-203ENST00000491165 2133 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 LIMD2-205ENST00000578402 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 RAB24-201ENST00000303251 1311 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 SAMD8-202ENST00000372690 1654 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 OLFM1-206ENST00000371799 961 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 IDNK-204ENST00000454393 1210 ntTSL 3 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 NDUFB2-207ENST00000465506 1101 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 ARF1-213ENST00000540651 1972 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 BCL7C-202ENST00000380317 2409 ntTSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 GPR35-204ENST00000430267 1399 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 SIX2-201ENST00000303077 2205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 NIPSNAP2-205ENST00000446778 1882 ntTSL 2 BASIC24.41■■□□□ 1.5
SELPP16109 FBXL22-201ENST00000360587 1526 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 LEF1-AS1-207ENST00000512637 1675 ntTSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 PHLDA3-201ENST00000367309 896 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 MFF-208ENST00000409616 1247 ntTSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 AC092675.2-201ENST00000413274 541 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 PGAP3-204ENST00000429199 970 ntTSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 AC068385.1-201ENST00000533218 409 ntTSL 3 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 LINC02136-201ENST00000567469 530 ntTSL 4 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 AL032819.3-201ENST00000640283 925 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 POU2F2-208ENST00000529952 1716 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 AKT1S1-203ENST00000391831 2025 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 ADPRHL2-201ENST00000373178 1668 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.4■■□□□ 1.5
SELPP16109 ZDHHC16-203ENST00000353979 1647 ntTSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.5
SELPP16109 UBE2D3-201ENST00000321805 1087 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELPP16109 MPRIP-203ENST00000395806 527 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELPP16109 AC140479.5-201ENST00000568189 735 ntTSL 3 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELPP16109 GNAO1-211ENST00000570235 568 ntTSL 2 BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELPP16109 BOP1-205ENST00000569669 2303 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.39■■□□□ 1.49
SELPP16109 ERI3-201ENST00000372257 1684 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 MYCL-201ENST00000372815 1944 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 SRPK3-205ENST00000393786 1900 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 TAF9-201ENST00000217893 1283 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 POLR2F-203ENST00000407936 582 ntTSL 3 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 POLR2F-207ENST00000460648 518 ntTSL 4 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 TMEM182-210ENST00000639249 1025 ntTSL 5 BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 NMI-201ENST00000243346 1623 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 SLC25A5-AS1-202ENST00000445759 1616 ntTSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 TRIM14-202ENST00000342043 1479 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.38■■□□□ 1.49
SELPP16109 MME-202ENST00000382989 1319 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 AC135048.1-201ENST00000566056 1318 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 AP002761.3-201ENST00000546324 1695 ntTSL 2 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 RELL2-205ENST00000518856 1419 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 ZNF517-207ENST00000531720 1615 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 RAB28-208ENST00000630951 1679 ntTSL 5 BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 RILP-201ENST00000301336 1771 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 NAAA-204ENST00000507187 1750 ntTSL 1 (best) BASIC24.37■■□□□ 1.49
SELPP16109 DOK3-205ENST00000501403 1872 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELPP16109 SCAND1-202ENST00000373991 1727 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELPP16109 NEDD8-201ENST00000250495 708 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELPP16109 STYXL1-204ENST00000360591 1127 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELPP16109 AC061979.1-201ENST00000532061 434 ntTSL 5 BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELPP16109 PEA15-201ENST00000360472 2471 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.36■■□□□ 1.49
SELPP16109 GAS2L1-201ENST00000406549 1803 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 PRDM13-202ENST00000369215 2429 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 MEIS2-204ENST00000397620 2295 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 STK19-202ENST00000375333 1557 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 AC006015.1-201ENST00000429970 570 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 SDHAP3-201ENST00000436493 736 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 DENND3-207ENST00000518347 850 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 KRT18P61-201ENST00000585825 1298 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 AC080038.1-201ENST00000611274 1154 ntBASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 RARA-203ENST00000394086 2008 ntTSL 2 BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 LINC00969-219ENST00000453324 1439 ntTSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 TMEM41B-207ENST00000611268 1440 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.35■■□□□ 1.49
SELPP16109 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 PPP1R1B-201ENST00000254079 1845 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 FIZ1-205ENST00000592585 489 ntTSL 5 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 VIM-AS1-202ENST00000605833 918 ntTSL 3 BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 ZNF598-202ENST00000562103 2717 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 TUBG1-201ENST00000251413 1611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 ESR2-202ENST00000341099 2060 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 TMEM121-201ENST00000392519 1532 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
SELPP16109 KCNG1-201ENST00000371571 2211 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.34■■□□□ 1.49
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 35.8 ms