Protein–RNA interactions for Protein: P13805

TNNT1, Troponin T, slow skeletal muscle, humanhuman

Predictions only

Length 278 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
TNNT1P13805 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 SPHK1-210ENST00000592299 1821 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TMEM159-201ENST00000233047 2014 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 RELA-201ENST00000308639 2681 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.31■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 CCDC102A-201ENST00000258214 2463 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FADS6-204ENST00000614223 2044 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FAM136A-202ENST00000430566 885 ntTSL 3 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FBXO7-206ENST00000452138 1535 ntTSL 2 BASIC24.3■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 ADARB1-205ENST00000437626 5032 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 BTBD6-201ENST00000327471 1948 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 CD37-213ENST00000598095 1598 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 DYRK3-202ENST00000367108 2218 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 RUNX3-202ENST00000338888 2629 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 IFI30-201ENST00000407280 1134 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 AC104002.3-202ENST00000557170 1100 ntTSL 3 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 AC087393.1-201ENST00000582896 145 ntBASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 SLC25A11-201ENST00000225665 1897 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TBC1D22A-202ENST00000355704 1886 ntTSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 PRELID2-201ENST00000334744 2140 ntTSL 2 BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 DUSP5-201ENST00000369583 2557 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 CACNG2-201ENST00000300105 2384 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.29■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TRIB3-201ENST00000217233 2499 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 HES6-201ENST00000272937 1454 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 FKBP1A-211ENST00000618612 1518 ntTSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 UBA5-211ENST00000493720 2058 ntTSL 5 BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.28■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 RPS6KL1-216ENST00000557413 2425 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 CAV2-201ENST00000222693 3301 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TMUB1-203ENST00000462940 1549 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 TMC6-212ENST00000589553 2389 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 IDNK-203ENST00000405990 629 ntTSL 2 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 ACOT1-201ENST00000311148 1713 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 MYO1C-203ENST00000438665 4898 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 EIF5A-211ENST00000576930 1439 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC24.27■■□□□ 1.48
TNNT1P13805 ENTPD4-201ENST00000356206 2097 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ENTPD4-203ENST00000417069 2063 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 UBXN2A-202ENST00000404924 1557 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PSMG4-207ENST00000451246 824 ntTSL 3 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 OXLD1-203ENST00000571503 803 ntTSL 2 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AC129492.7-201ENST00000622992 756 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 LRRC24-202ENST00000533758 1701 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AC090877.2-201ENST00000558441 1738 ntBASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PPP1R13B-201ENST00000202556 4958 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CIZ1-206ENST00000372954 2731 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.26■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CERKL-205ENST00000409440 2425 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 DUSP7-202ENST00000495880 3340 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ASPSCR1-202ENST00000306739 1843 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 LRP5-201ENST00000294304 5159 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AC109460.3-201ENST00000569969 5296 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PAQR6-202ENST00000335852 2117 ntTSL 2 BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SLC1A5-203ENST00000542575 2882 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.25■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 MRPL10-202ENST00000351111 1725 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 TMEM44-204ENST00000392432 2490 ntTSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PTGER3-204ENST00000356595 1943 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PTGER3-207ENST00000370931 1914 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 TFG-201ENST00000240851 1978 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 LINC01011-201ENST00000445000 2811 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 KRT18P60-201ENST00000312876 1297 ntBASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 YPEL1-202ENST00000403503 466 ntTSL 3 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 UBE2I-213ENST00000566587 1098 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 HOMER3-201ENST00000221222 1384 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 COCH-201ENST00000216361 2397 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 CPNE7-202ENST00000319518 2409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 PON2-218ENST00000633531 1653 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC24.24■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AL121603.2-201ENST00000557373 2117 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 DTWD2-203ENST00000510708 2307 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 EFHD2-201ENST00000375980 2419 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 HUNK-201ENST00000270112 7385 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 ERMP1-202ENST00000339450 5376 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC24.23■■□□□ 1.47
TNNT1P13805 AL592295.1-201ENST00000400984 884 ntBASIC24.23■■□□□ 1.47
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 26 ms