Protein–RNA interactions for Protein: P12018

VPREB1, Immunoglobulin iota chain, humanhuman

Predictions only

Length 145 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
VPREB1P12018 RNF39-202ENST00000376751 1970 ntTSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 FDFT1-201ENST00000220584 2176 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.29□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IRX2-202ENST00000382611 2630 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 KHDRBS2-201ENST00000281156 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CCSAP-201ENST00000284617 5121 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ATP9A-202ENST00000338821 8106 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 OLIG2-202ENST00000382357 2578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 NHLRC4-202ENST00000540585 2071 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 LSM7-203ENST00000585409 512 ntTSL 2 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC074183.2-201ENST00000623112 922 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ZNF316-201ENST00000382252 5392 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ANKLE2-201ENST00000357997 4646 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.28□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MYB-221ENST00000527615 2381 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 EFCAB1-202ENST00000433756 2286 ntTSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 CLN6-201ENST00000249806 2243 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ORAI1-202ENST00000617316 2138 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 VSX1-205ENST00000429762 1977 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 MIR222HG-201ENST00000602461 1379 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 IQSEC3-201ENST00000382841 2701 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.12
VPREB1P12018 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ABHD17AP5-201ENST00000580133 923 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ERO1A-211ENST00000629528 998 ntTSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SLC29A1-207ENST00000393841 2485 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PITX1-201ENST00000265340 2406 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 NRXN2-205ENST00000409571 6381 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ZNF568-208ENST00000586353 1902 ntTSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LRRC75A-201ENST00000409083 2656 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LGALS9C-201ENST00000328114 1730 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC14.27□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ILDR2-205ENST00000526687 2299 ntTSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 YWHAZ-205ENST00000395956 2974 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 H2AFY-204ENST00000423969 924 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TSPAN17-207ENST00000508164 2457 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PDE5A-201ENST00000264805 3020 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RBPJL-202ENST00000372741 1636 ntTSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PPP3CC-202ENST00000289963 2135 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.26□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 FNDC11-204ENST00000615526 2954 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 NRXN2-204ENST00000377559 6413 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 DNAJC25-GNG10-201ENST00000374294 1448 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CCDC106-205ENST00000588740 1404 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 DISC1-223ENST00000628350 2363 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 APOE-201ENST00000252486 1208 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CNPY3-202ENST00000394142 954 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 VSTM2A-202ENST00000402613 1076 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 LMF1-202ENST00000543238 2103 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TMEM170A-206ENST00000569276 609 ntTSL 2 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 NR5A1-204ENST00000620110 2975 ntTSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RHOT1-205ENST00000545287 2516 ntAPPRIS P4 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 BLOC1S4-201ENST00000320776 1617 ntAPPRIS P1 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC144652.1-201ENST00000609974 1624 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 DYRK1B-204ENST00000593685 2724 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CACNB1-201ENST00000344140 1889 ntTSL 1 (best) BASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC14.25□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PICK1-202ENST00000404072 2164 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 XYLT1-201ENST00000261381 9891 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 PKIB-205ENST00000368452 1398 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 AC078883.1-201ENST00000442417 950 ntTSL 3 BASIC14.24□□□□□ -0.13
VPREB1P12018 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC14.24□□□□□ -0.13
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 19.2 ms