Protein–RNA interactions for Protein: P0CX22

YRF1-8, Y' element ATP-dependent helicase protein 1 copy 8, yeastyeast

Predictions only

Length 1,796 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (RIP-Chip)
Gene UniProt Accession Gene Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score Detected Interaction
YRF1-8P0CX22 CDC8YJR057W 651 nt5.15□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 ATG8YBL078C 354 nt5.15□□□□□ -1.58
YRF1-8P0CX22 RPB3YIL021W 957 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 YIL054WYIL054W 318 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 SNF2YOR290C 5112 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 KAP114YGL241W 3015 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PEX7YDR142C 1128 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 DER1YBR201W 636 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 AIM17YHL021C 1398 nt5.14□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 UBX5YDR330W 1503 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 VMS1YDR049W 1899 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 TFC6YDR362C 2019 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 EIS1YMR031C 2532 nt5.13□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 APE1YKL103C 1545 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 YJR128WYJR128W 360 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PFA4YOL003C 1137 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 ECM21YBL101C 3354 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 IML2YJL082W 2196 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PRP19YLL036C 1512 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 SEG2YKL105C 3399 nt5.12□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 COS8YHL048W 1146 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 TMA10YLR327C 261 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 MRPL16YBL038W 699 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 ECM22YLR228C 2445 nt5.11□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 THI7YLR237W 1797 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PAM1YDR251W 2493 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 VTA1YLR181C 993 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PFK26YIL107C 2484 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 MDM1YML104C 3384 nt5.1□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 ARN2YHL047C 1863 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 DBF4YDR052C 2115 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 ZRC1YMR243C 1329 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 NKP1YDR383C 717 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PWR1PWR1 941 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 CST6YIL036W 1764 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 YML020WYML020W 1995 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 CHL4YDR254W 1377 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 PIM1YBL022C 3402 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 IRS4YKR019C 1848 nt5.09□□□□□ -1.59
YRF1-8P0CX22 COX14YML129C 213 nt5.09□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YPL114WYPL114W 420 nt5.09□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 PEX29YDR479C 1665 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 RRN3YKL125W 1884 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 VPS73YGL104C 1461 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 NOP7YGR103W 1818 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 TEF4YKL081W 1239 nt5.08□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YEN1YER041W 2280 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 EXO5YBR163W 1758 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YJL175WYJL175W 513 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 SGT1YOR057W 1188 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YCF1YDR135C 4548 nt5.07□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YGR051CYGR051C 324 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 MAK16YAL025C 921 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 BUB1YGR188C 3066 nt5.06□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 CHD1YER164W 4407 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 PEA2YER149C 1263 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 RPL8BYLL045C 771 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 MCK1YNL307C 1128 nt5.05□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 ARG5,6YER069W 2592 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 HAT2YEL056W 1206 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 TEM1YML064C 738 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 NIP7YPL211W 546 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 SRB6YBR253W 366 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 XKS1YGR194C 1803 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YLR156WYLR156W 345 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YLR159WYLR159W 345 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YLR161WYLR161W 345 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 YBR137WYBR137W 540 nt5.04□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 RIM15YFL033C 5313 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 SHE1YBL031W 1017 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 RIM11YMR139W 1113 nt5.03□□□□□ -1.6
YRF1-8P0CX22 BOI2YER114C 3123 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 snR42snR42 351 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 APE2YKL157W 2859 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 TDA7YNL176C 1911 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 IME4YGL192W 1803 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 SYT1YPR095C 3681 nt5.02□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 YER034WYER034W 558 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)DtK(UUU)D 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)G1tK(UUU)G1 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)G2tK(UUU)G2 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)KtK(UUU)K 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)LtK(UUU)L 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)OtK(UUU)O 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 tK(UUU)PtK(UUU)P 73 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 PBP2YBR233W 1242 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 YCL021W-AYCL021W-A 378 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 RAI1YGL246C 1164 nt5.01□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 AVT1YJR001W 1809 nt5□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 BMH2YDR099W 822 nt5□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 YBL059WYBL059W 582 nt5□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 YFL052WYFL052W 1398 nt5□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 MEC3YLR288C 1425 nt4.99□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 RPL8AYHL033C 771 nt4.99□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 ATG11YPR049C 3537 nt4.99□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 URA7YBL039C 1740 nt4.99□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 CPR6YLR216C 1116 nt4.99□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 ARR1YPR199C 885 nt4.98□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 MKC7YDR144C 1791 nt4.97□□□□□ -1.61
YRF1-8P0CX22 PAN5YHR063C 1140 nt4.97□□□□□ -1.61
Retrieved 100 of 7,029 protein–RNA pairs in 14.9 ms