Protein–RNA interactions for Protein: O95833

CLIC3, Chloride intracellular channel protein 3, humanhuman

Predictions only

Length 236 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CLIC3O95833 NRL-202ENST00000396997 1517 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 AL022069.1-201ENST00000568025 1636 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 HS3ST6-201ENST00000454677 1273 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 MIR3648-2-201ENST00000581792 180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 MIR3648-1-201ENST00000615959 180 ntBASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 DUSP22-201ENST00000344450 1485 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 TGIF1-206ENST00000405385 1689 ntTSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 ZNF707-201ENST00000358656 2183 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 UHRF1BP1L-202ENST00000356828 2023 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.53■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 TMEM129-201ENST00000303277 2678 ntTSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 CCDC185-201ENST00000366875 2054 ntAPPRIS P1 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 SPRN-201ENST00000414069 3128 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 RAP2CP1-202ENST00000605179 643 ntBASIC20.52■□□□□ 0.88
CLIC3O95833 TMEM98-206ENST00000579849 4434 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.52■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 E4F1-204ENST00000564139 2493 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 CAMK1-201ENST00000256460 1488 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 DOK3-201ENST00000312943 2292 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 DEXI-202ENST00000469379 1393 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 CDK5R2-201ENST00000302625 2508 ntAPPRIS P1 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 VIPR2-204ENST00000421760 717 ntTSL 3 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 FLVCR1-AS1-203ENST00000426161 892 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ECEL1P2-201ENST00000461596 1295 ntBASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 IRF3-227ENST00000600911 1637 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PARD3-209ENST00000374790 5825 ntTSL 5 BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 FBXO25-202ENST00000350302 2229 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 BX005266.2-202ENST00000446626 2245 ntTSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ERLEC1-202ENST00000378239 2271 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.51■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PEX6-201ENST00000244546 2696 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PLD6-201ENST00000321560 2560 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ABLIM2-205ENST00000428004 2573 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AOC1-202ENST00000416793 2453 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MXD3-208ENST00000513063 861 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 C16orf95-205ENST00000567970 1031 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AC026202.3-201ENST00000600805 1127 ntBASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 NUDT10-201ENST00000356450 1917 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MCAT-201ENST00000290429 2056 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 FNTA-208ENST00000529687 1950 ntTSL 2 BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 FAM19A4-201ENST00000295569 2292 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.5■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 S1PR5-202ENST00000439028 2191 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MAGIX-207ENST00000615915 1757 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 LOR-201ENST00000368742 1230 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 RIPPLY2-202ENST00000369689 664 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ARL6IP4-208ENST00000439686 796 ntAPPRIS ALT2 TSL 3 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ASAP2-201ENST00000281419 5712 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 GADD45GIP1-201ENST00000316939 1782 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 VPS9D1-AS1-202ENST00000562866 1753 ntTSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 WNT10A-201ENST00000258411 2547 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.49■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 WFDC1-201ENST00000219454 1534 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 TXNDC5-201ENST00000379757 2964 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 GALNT10-202ENST00000377661 3778 ntTSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 BOK-201ENST00000318407 2657 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 GSPT1-203ENST00000439887 2509 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MADCAM1-206ENST00000617201 1491 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MADCAM1-207ENST00000619333 1485 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 MADCAM1-210ENST00000622462 1461 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC20.48■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ARRB2-201ENST00000269260 1895 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 CCDC130-201ENST00000221554 1792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 IQCJ-SCHIP1-203ENST00000476809 1780 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PPP1R3F-201ENST00000055335 3421 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AC016575.1-201ENST00000607026 382 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 KCNMA1-209ENST00000372443 5059 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PARD3-202ENST00000346874 5894 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PARD3-203ENST00000350537 5867 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 GNG4-203ENST00000391854 5104 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AC004691.2-201ENST00000509504 1531 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AC010542.4-201ENST00000563151 1910 ntBASIC20.47■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 NOS3-204ENST00000467517 2377 ntTSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ANKRD9-204ENST00000559651 1444 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 RELT-202ENST00000393580 2669 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 EPHA6-202ENST00000470610 2058 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 PILRB-207ENST00000448382 2314 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 FAAP20-202ENST00000378546 729 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AC007029.1-201ENST00000604183 313 ntBASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 AC013394.1-201ENST00000629685 808 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 UBC-201ENST00000339647 2688 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 LETM1-201ENST00000302787 5462 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ARHGEF7-202ENST00000317133 4361 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 ENTPD6-203ENST00000376652 2750 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC20.46■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 RAP2C-202ENST00000370874 2333 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.87
CLIC3O95833 RHOBTB3-206ENST00000506817 1432 ntTSL 2 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIC3O95833 AKT2-206ENST00000392038 5300 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIC3O95833 GUCY1A3-210ENST00000513574 2656 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIC3O95833 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIC3O95833 COL13A1-202ENST00000357811 2991 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIC3O95833 U2AF1L5-202ENST00000619610 813 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
CLIC3O95833 ATP6AP1-201ENST00000369762 2099 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC20.45■□□□□ 0.86
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 81.9 ms