Protein–RNA interactions for Protein: O95562

SFT2D2, Vesicle transport protein SFT2B, humanhuman

Predictions only

Length 160 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SFT2D2O95562 BX088645.1-201ENST00000636699 1728 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ZYG11B-202ENST00000545132 2294 ntTSL 2 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PALM-208ENST00000592155 2272 ntTSL 4 BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 TBC1D12-201ENST00000225235 5272 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.44■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 EFS-202ENST00000351354 2704 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ST3GAL4-202ENST00000356132 1745 ntTSL 5 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 DALRD3-206ENST00000441576 1706 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 MAP3K3-201ENST00000361357 4818 ntTSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PPM1J-201ENST00000309276 1863 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PHACTR3-202ENST00000359926 2252 ntTSL 2 BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 SLC16A10-202ENST00000368851 2508 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.43■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CRACR2B-202ENST00000525077 1578 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 EEFSEC-201ENST00000254730 2232 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 RDX-204ENST00000528498 2511 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 KCNMA1-252ENST00000639120 2308 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ZFAND2B-206ENST00000409336 944 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 HES4-204ENST00000484667 667 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CRNDE-206ENST00000559432 587 ntTSL 3 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ZFAND2B-221ENST00000621130 1070 ntTSL 5 BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 NTNG2-202ENST00000393229 4792 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PEX10-202ENST00000447513 1997 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CBWD5-202ENST00000377384 1347 ntTSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PCSK6-217ENST00000618548 4269 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 MFSD7-203ENST00000404286 1826 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 OSCAR-202ENST00000351806 1375 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.42■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 IGSF21-201ENST00000251296 1943 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PABPC1L2B-201ENST00000373521 2197 ntAPPRIS P1 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 FBXW11-203ENST00000393802 2181 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CIZ1-204ENST00000372938 2984 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 CCDC92-209ENST00000545891 1790 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ARHGEF25-201ENST00000286494 2552 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 NAGPA-202ENST00000381955 2100 ntTSL 5 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ANKHD1-205ENST00000394723 2135 ntTSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 AL353803.4-201ENST00000565882 1934 ntBASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 LTBP3-201ENST00000301873 4443 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.41■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 TFAP2A-202ENST00000379608 2576 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 FGFR2-211ENST00000369059 3003 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 OLFM1-204ENST00000371793 2444 ntAPPRIS P1 TSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 FBXO27-202ENST00000509137 2130 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ACHE-201ENST00000241069 2172 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 HMG20B-202ENST00000333651 1596 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 MACROD1-201ENST00000255681 1205 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PSMG4-206ENST00000438998 838 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 AC187653.1-201ENST00000506382 702 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 NKX2-5-204ENST00000521848 1027 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PLEKHJ1-204ENST00000586608 935 ntTSL 3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 GTPBP6-201ENST00000326153 1907 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 EML2-201ENST00000245925 2264 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 DAPK3-202ENST00000545797 2257 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 TMEM121B-201ENST00000331437 4954 ntAPPRIS P3 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 ZDHHC8P1-201ENST00000255890 2382 ntTSL 2 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 UTS2R-201ENST00000313135 1357 ntAPPRIS P1 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 STARD3NL-201ENST00000009041 1728 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 MOB4-204ENST00000409360 1447 ntTSL 5 BASIC18.4■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PABPC1L2A-201ENST00000373519 2237 ntAPPRIS P1 BASIC18.39■□□□□ 0.54
SFT2D2O95562 PFKFB4-204ENST00000416568 1575 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 MESP1-201ENST00000300057 2369 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 RALGPS1-207ENST00000394022 1672 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 UPF3A-209ENST00000492270 494 ntTSL 2 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 AC087742.1-201ENST00000575880 1738 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 FBRS-202ENST00000356166 5200 ntTSL 5 BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 SYNGR2-201ENST00000225777 2325 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 CADPS-202ENST00000357948 5190 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 FBXO17-201ENST00000292852 2386 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 NFU1-203ENST00000410022 1467 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 GGTA1P-203ENST00000481799 1487 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 FAM99A-202ENST00000538190 1989 ntBASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 POTED-202ENST00000620442 1988 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC18.39■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 CERS5-201ENST00000317551 2051 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 TMEFF1-201ENST00000374879 2611 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 GNB1-209ENST00000610897 3145 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 MAPK3-203ENST00000395199 1074 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 MAPK3-205ENST00000395202 1008 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 PTPA-210ENST00000414510 1153 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 CDKN2A-214ENST00000579755 1283 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 ZXDC-201ENST00000336332 2579 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 TANGO2-210ENST00000432883 2084 ntTSL 2 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 MED22-201ENST00000343730 1437 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 EBF4-202ENST00000380648 2910 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 ORAI3-201ENST00000318663 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 MTERF3-204ENST00000523821 1529 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 TMEM9B-201ENST00000309134 1659 ntTSL 1 (best) BASIC18.38■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 PBX4-201ENST00000251203 1724 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 DACT1-204ENST00000541264 2610 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 STK11-205ENST00000586243 2777 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 DCAF4-202ENST00000358377 2024 ntAPPRIS P4 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 CMTM4-201ENST00000330687 3414 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 MAP7D1-201ENST00000316156 3456 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 CPEB1-218ENST00000620182 2422 ntTSL 2 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 AC138647.1-201ENST00000427937 648 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 AC016595.1-201ENST00000559410 383 ntTSL 3 BASIC18.37■□□□□ 0.53
SFT2D2O95562 FGF22-202ENST00000586042 1288 ntTSL 1 (best) BASIC18.37■□□□□ 0.53
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15 ms