Protein–RNA interactions for Protein: O75563

SKAP2, Src kinase-associated phosphoprotein 2, humanhuman

Predicted RBP Predictions only

Length 359 aa.

Download Table  
Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
SKAP2O75563 AL590677.1-201ENST00000438431 380 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 HYI-210ENST00000486909 905 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 GPRC5B-202ENST00000535671 1215 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 GAK-223ENST00000628912 497 ntTSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 FYN-204ENST00000368678 2573 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 EED-201ENST00000263360 2223 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 OSCAR-211ENST00000617140 1547 ntAPPRIS ALT2 TSL 5 BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MED25-211ENST00000617849 1548 ntTSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 SPEF1-201ENST00000379756 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.95■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 CLPB-202ENST00000340729 2071 ntTSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 PPP1CC-201ENST00000335007 2559 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 GALR2-201ENST00000329003 1364 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 CIRBP-216ENST00000588090 1459 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 ZFYVE19-201ENST00000299173 1555 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 IKBIP-202ENST00000342502 1645 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 LINC00092-201ENST00000412122 1726 ntTSL 1 (best) BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 PLK5-202ENST00000454744 1930 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.94■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 AKT2-210ENST00000424901 5170 ntTSL 5 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 SERPINB5-201ENST00000382771 2783 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 TMEM250-205ENST00000561457 2804 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 SPINT2-201ENST00000301244 1802 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 TMEM235-205ENST00000586400 2272 ntTSL 1 (best) BASIC21.93■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 RASGRP2-210ENST00000394430 2174 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 DPEP2-204ENST00000572888 2112 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 C3orf58-207ENST00000495414 1876 ntTSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 METTL9-202ENST00000396014 1817 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MTERF3-201ENST00000287025 1409 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 OXLD1-201ENST00000374741 620 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 TRIM52-AS1-202ENST00000507434 672 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MMP25-AS1-209ENST00000576250 779 ntTSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 HSD17B1P1-201ENST00000590052 955 ntBASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 DISC1-212ENST00000535983 2505 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 AR-209ENST00000613054 3532 ntTSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 TPST2-203ENST00000403880 2084 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 LPAR1-201ENST00000358883 2687 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 KCNK15-201ENST00000372861 2599 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.92■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 ABCG4-204ENST00000615496 2459 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 EGR3-203ENST00000519492 1500 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 PLEKHH3-201ENST00000293349 2987 ntAPPRIS ALT1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 EXOC3L2-202ENST00000413988 2964 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 ZFP64-206ENST00000371523 2234 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 ACHE-203ENST00000411582 2179 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 GRK4-206ENST00000504933 1971 ntTSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MDK-206ENST00000407067 1026 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 AL121899.1-202ENST00000411839 536 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 AC139795.1-202ENST00000500444 432 ntBASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MPP5-205ENST00000556345 1163 ntTSL 2 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 EME2-205ENST00000568449 1234 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 KCTD13-207ENST00000568000 2528 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 GSX2-201ENST00000326902 1812 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 YAP1-202ENST00000345877 5284 ntTSL 5 BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 RAD9A-201ENST00000307980 2119 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 GJD4-201ENST00000321660 1580 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.91■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 HMGA2-203ENST00000393578 1993 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 PRSS29P-202ENST00000568091 1864 ntTSL 5 BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MVD-201ENST00000301012 1823 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 MARK3-206ENST00000440884 2643 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 AQP1-202ENST00000409611 1140 ntTSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 DUX4L18-201ENST00000553347 1267 ntBASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 LGR4-201ENST00000379214 5206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 KLF9-201ENST00000377126 5175 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.9■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 FOXK2-201ENST00000335255 5265 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 CAPN12-201ENST00000328867 2762 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 IQCJ-SCHIP1-204ENST00000485419 2445 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 HCN2-201ENST00000251287 3408 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 ZNF444-201ENST00000337080 2042 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 PXK-202ENST00000356151 2037 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.1
SKAP2O75563 PHLDA3-202ENST00000367311 2640 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC007383.2-202ENST00000435627 482 ntTSL 2 BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 ZNF584-201ENST00000306910 2332 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 EPDR1-201ENST00000199448 2599 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC21.89■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 NFS1-204ENST00000397425 1956 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 MMP21-201ENST00000368808 1919 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PNCK-215ENST00000447676 1585 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 MTCH2-201ENST00000302503 2587 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 CST6-201ENST00000312134 759 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC139795.1-203ENST00000515045 853 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 HOMER3-207ENST00000594794 903 ntTSL 5 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 EVX1-201ENST00000222761 1500 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 CADM1-201ENST00000331581 1766 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 RASEF-201ENST00000340717 1765 ntTSL 2 BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 GRK4-201ENST00000345167 2013 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 H2AFY2-201ENST00000373255 1980 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 MMP24-201ENST00000246186 4414 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PFKP-201ENST00000381072 1698 ntTSL 1 (best) BASIC21.88■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC079630.1-202ENST00000618127 1840 ntBASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 IRF3-228ENST00000601291 1556 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 DISC1-220ENST00000602873 1553 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 GAL3ST1-202ENST00000401975 1791 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LHPP-201ENST00000368839 1522 ntTSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.87■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 TATDN2-201ENST00000287652 5342 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 DLL3-202ENST00000356433 2055 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 ZNF467-201ENST00000302017 2553 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LY6H-201ENST00000342752 951 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 C20orf24-203ENST00000373852 1059 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LY6H-202ENST00000414417 1056 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 LY6H-203ENST00000430474 925 ntAPPRIS P3 TSL 3 BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 PTCH1-210ENST00000468211 1254 ntTSL 1 (best) BASIC21.86■■□□□ 1.09
SKAP2O75563 AC022616.5-201ENST00000518796 181 ntBASIC21.86■■□□□ 1.09
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 17 ms