Protein–RNA interactions for Protein: O60308

CEP104, Centrosomal protein of 104 kDa, humanhuman

Predictions only

Length 925 aa.

Protein RNA Prediction (catRAPID) Interaction (ENCODE eCLIP)
Gene UniProt Accession Transcript Symbol Ensembl Transcript ID Length Transcript Status Prediction Score Prediction z-Score p-Value Fold Change
CEP104O60308 BIN1-209ENST00000393040 2293 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.38■■□□□ 1.33
CEP104O60308 LINC01140-202ENST00000467438 2375 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ADCK2-203ENST00000476491 2092 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 RNF149-201ENST00000295317 2458 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SLC19A1-209ENST00000485649 1896 ntAPPRIS ALT2 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SLCO3A1-202ENST00000424469 2705 ntTSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 CACNG8-201ENST00000270458 8747 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 PRELID1-201ENST00000303204 1261 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 IDNK-201ENST00000376417 511 ntTSL 5 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 IDNK-202ENST00000376419 692 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 THA1P-201ENST00000590384 1145 ntBASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 MATK-203ENST00000395045 2073 ntAPPRIS P4 TSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 RASSF5-202ENST00000579436 2064 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AC145124.1-201ENST00000528514 1361 ntTSL 2 BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 IL15RA-204ENST00000379977 1626 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.37■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ZFAND2B-201ENST00000289528 1314 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AMER2-202ENST00000515384 3197 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ACVRL1-201ENST00000388922 1971 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AC139530.1-201ENST00000575312 1977 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ARIH2OS-201ENST00000408959 1598 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 GPRC5B-210ENST00000569847 1830 ntAPPRIS P2 TSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 KRT18P24-201ENST00000344739 1156 ntBASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 CDCA5-202ENST00000404147 1012 ntTSL 2 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 MCRIP1-210ENST00000576431 577 ntTSL 5 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 H2AFB1-201ENST00000620016 587 ntAPPRIS P1 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 DDN-AS1-202ENST00000547866 2114 ntTSL 3 BASIC23.36■■□□□ 1.33
CEP104O60308 UROS-204ENST00000368797 1313 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 DCTD-201ENST00000357067 1931 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SLC35F5-203ENST00000409342 2284 ntTSL 2 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 CNEP1R1-202ENST00000427478 2117 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 KDM3B-201ENST00000314358 6813 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ST7L-201ENST00000343210 1866 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AC148477.1-201ENST00000537720 476 ntTSL 3 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SEPT5-201ENST00000383045 1588 ntTSL 5 BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SMURF1-201ENST00000361125 5737 ntTSL 1 (best) BASIC23.35■■□□□ 1.33
CEP104O60308 C1orf35-201ENST00000272139 1427 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 CDKN1C-202ENST00000414822 2051 ntAPPRIS P3 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 CSNK1G2-201ENST00000255641 2918 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 P4HTM-201ENST00000343546 2268 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 FAM102B-201ENST00000370035 5600 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 EN1-201ENST00000295206 2457 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AC092053.2-201ENST00000640557 1818 ntBASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 TLX2-201ENST00000233638 2136 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ARL13B-205ENST00000471138 2206 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 MARCH2-201ENST00000215555 1376 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 KEAP1-202ENST00000393623 2648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 ASPSCR1-208ENST00000580534 1776 ntTSL 2 BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 TRIM67-203ENST00000449018 2166 ntTSL 1 (best) BASIC23.34■■□□□ 1.33
CEP104O60308 TMEM259-202ENST00000356663 2748 ntAPPRIS ALT2 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 VGF-202ENST00000445482 2477 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SLC12A5-AS1-202ENST00000535913 1957 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 GATA4-207ENST00000532059 1459 ntAPPRIS ALT1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 COPRS-201ENST00000302362 968 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 AC116025.2-201ENST00000576632 443 ntTSL 3 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 TBX2-AS1-203ENST00000590421 861 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 SSX2IP-209ENST00000603677 1149 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 PVT1_1.1-201ENST00000615125 194 ntBASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 LSM14B-201ENST00000279068 2548 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.33
CEP104O60308 PTP4A3-204ENST00000521578 1717 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP104O60308 SLC25A1-201ENST00000215882 1648 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP104O60308 HSF4-225ENST00000584272 1549 ntTSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP104O60308 ALDH16A1-202ENST00000455361 2470 ntTSL 2 BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PSPH-202ENST00000395471 2178 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.33■■□□□ 1.32
CEP104O60308 USP48-205ENST00000421625 2818 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 AC080038.3-201ENST00000623346 1952 ntBASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 TMEM151B-202ENST00000451188 4895 ntAPPRIS P2 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 HSD11B1L-217ENST00000581521 1884 ntAPPRIS P3 TSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PHF2-201ENST00000359246 5569 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 BRD4-212ENST00000630599 726 ntTSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 AC064853.2-201ENST00000641246 144 ntAPPRIS P1 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 TMEM230-205ENST00000379279 1636 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 NRL-203ENST00000397002 1976 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CCM2-206ENST00000474617 1532 ntTSL 5 BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CDC20-202ENST00000372462 1777 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 JAGN1-201ENST00000307768 1693 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.32■■□□□ 1.32
CEP104O60308 C11orf96-202ENST00000528572 1834 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 GPR27-201ENST00000304411 2447 ntAPPRIS P1 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 SYNGR3-202ENST00000562045 1743 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 COMMD5-201ENST00000305103 1373 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 C7orf25-203ENST00000431882 1645 ntTSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 ANO8-201ENST00000159087 4152 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 GBX1-201ENST00000297537 1092 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 NDUFA10-204ENST00000407129 699 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 NTF6A-201ENST00000591175 560 ntBASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 RITA1-202ENST00000549621 2041 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CCDC38-201ENST00000344280 2277 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 SIGLEC15-201ENST00000389474 1573 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 SLC25A47-202ENST00000557052 1552 ntTSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 TERF2-201ENST00000254942 2983 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.31■■□□□ 1.32
CEP104O60308 MPST-202ENST00000397225 2116 ntAPPRIS P1 TSL 2 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP104O60308 AKT1S1-206ENST00000391834 1849 ntAPPRIS P1 TSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CXCL14-201ENST00000337225 1971 ntAPPRIS P2 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP104O60308 ZC3H14-223ENST00000557607 1983 ntTSL 5 BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PLPP5-203ENST00000424479 2130 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP104O60308 AP004608.1-202ENST00000533390 1863 ntTSL 1 (best) BASIC23.3■■□□□ 1.32
CEP104O60308 DNM2-205ENST00000585892 2774 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 SIMC1-202ENST00000341199 2056 ntAPPRIS P3 TSL 2 BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 CBLN3-201ENST00000267406 2346 ntAPPRIS P1 TSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 ZSCAN1-202ENST00000391700 952 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
CEP104O60308 PYY2-202ENST00000441253 1076 ntTSL 1 (best) BASIC23.29■■□□□ 1.32
Retrieved 100 of 98,524 protein–RNA pairs in 15.8 ms